预防抗生素耐药性

快速dna测序技术可用于快速识别引起感染的细菌。
10月21日

采访

约翰·韦恩,东英吉利大学

东安格利亚大学微生物学教授约翰·韦恩向凯特·阿尼解释说,快速dna测序技术可用于快速识别引起感染的细菌,这意味着可以对患者进行窄谱靶向药物治疗,副作用必然更少。

Kat -目前如何识别细菌感染,需要多长时间?

所以,目前的鉴定是通过微生物实验室的培养来进行的。所以,我们必须种植它们。有些人称之为化学园艺,但我们还需要几天的时间才能真正得到结果。这意味着当你去看全科医生时,医生会根据临床理由给你抗生素。所以,他们会给你检查一下,决定你是否感染了然后决定是否给你开抗生素,然后取样本,然后得出诊断结果。

所以,这有点像在黑暗中拍摄的方法,如果你一开始就选错了,那就很严重了。

约翰:这就是为什么广谱抗生素的想法很受欢迎。所以很明显,如果你是在黑暗中射击,那么你想要一个非常广泛的目标,这样你才能确保你击中了你真正射击的目标。

那么,我们要如何使用新的基因技术来精确地对付这些虫子呢?

约翰:好吧,显然使用广谱是有问题的。有附带损害的问题正如我们听到的艰难梭状芽胞杆菌-如果你干扰了肠道菌群,你很可能会得到病原体的过度生长。所以,这个特定的想法是,我们只得到病原体,而不伤害正常的菌群。所以,有两种方法可以解决这个问题。首先,有了好的诊断,这就是这些测序新技术真正能起作用的地方。所以,我们听说过能够识别微生物群。如果你采集了正确的样本,你也可以识别出引起感染的病原体,如果你能足够快地进行测序,那么你就可以获得实时证据,这样你就可以使用靶向抗生素。

Kat -我们现在谈论的速度有多快,我们现在能多快做到这一点,你认为未来它会多快成为可能?

John:目前我们最快能做到的就是一天做两次大规模的测序。24到48小时实际上是你目前能做的最快的时间。但这是在实验室的大型机器上进行的。有一些新技术正在问世,它们看起来就像你放进电脑里的USB棒。我相信,在不久的将来,这些将更快地给我们带来结果。

凯特-所以,这是非常积极的事情。但是,我们如何利用这些信息使治疗更有效,特别是克服耐药性的问题呢?

所以,使用靶向抗生素的另一个问题是开发靶向抗生素。所以,有很多化学物质,很多小分子,很多化合物会攻击细菌。所以,我们知道我们可以杀死这种细菌,但问题是,如何将这些细菌杀灭,化学家称之为杀灭优化。所以,选择那些化合物中的哪一个来进行处理。然后使用高通量测序技术,我们现在可以用x光透视细菌,我们可以看到细菌的内部,并确切地找出这些小分子在做什么。这使得化学家可以更有效地优化它们,这样我们就可以选择将哪些放入铅op中。

Kat -我想这和我们现在看到的针对癌症的靶向治疗有很多相似之处,不是吗?

约翰:是的,确实如此。很明显,它和我们听到的噬菌体疗法有相似之处。

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