会是一条神秘的鱼吗

据推测,遗传学家可以利用鱼缸里的水来确定鱼缸里曾经装过什么鱼。这是真的吗?
2019年11月8日

采访

Tony Sapsford, Frog End Aquatics;露易丝·弗雷泽,Illumina

MYSTERY_FISH.png

鱼上面有一个问号。

分享

据推测,遗传学家可以利用鱼缸里的水来确定鱼缸里曾经含有的鱼的种类。这是真的吗?为了验证这一点,菲尔·桑索姆去见了托尼·萨普斯福德,他是Frog End Aquatics的老板——我们的神秘鱼就住在那里……

托尼:我叫托尼,是蛙尾水上运动公司的老板。

Phil - And Frog End Aquatics,如果你在背景中听不到的话,里面装满了冒着泡泡的鱼缸。

托尼:如果你喜欢的话,那基本上就是一个大型的热带水族馆。总共有86个坦克。

菲尔:86 ?

托尼:86个热带水箱,10个冷水水箱,2个大型锦鲤池塘和4个海洋水箱。

菲尔:这里有多少鱼?

托尼:上帝啊,大概有五六千吧。

菲尔:我去那里是为了一种特别的鱼。但当托尼领着我走过一个又一个五颜六色的坦克时,我忍不住分心了。

菲尔:哇。

托尼:嗯,正如你所看到的,有海马、虾。这是盐水。

菲尔:天哪,我都忘了海马有多漂亮了。它们又小又黑。

托尼:是的。

菲尔:托尼,你有最喜欢的鱼吗?

托尼:是的。老实说,这些天我最喜欢的是河豚。三十多年前,当我开始有这个爱好的时候,我拥有的第一件东西就是一条巨大的河豚。

菲尔:真的吗?

托尼:这就是我喜欢上它的原因。我有一条大的——差不多有15英寸长。它真的会装满水,当它想下去的时候,它就会爬到表面,把水吐出来。

菲尔:真的吗?

托尼:对,对,它们很酷。

菲尔-够分心了。我去那里是有工作要做。

托尼:好的,我们正往这边走。

菲尔:我们去了一个水箱,里面有一种非常特殊的鱼。我有一个冲洗干净的果酱罐,我把它交给托尼去采集水样。

菲尔:哦,天哪,你把手伸进去了!

托尼:它不会伤害我的,相信我。

菲尔:你确定吗?

托尼:是的。

菲尔:你只是把你的手留在那里!

托尼:是的,他们真的很害羞,他们只会躲在电梯后面。

菲尔:我想他们一定会喜欢你的。

托尼:不,一点也不,它们是非常非常害羞的东西。

菲尔-我从我的神秘鱼的水箱里取了水样本。

菲尔:你想在里面找到什么?

托尼:可能是鱼粪。它们应该能找到鱼粪,可能还有它们今天吃过的东西的残余物——我的意思是,它们吃东西很乱。

现在水的样本已经准备好了,菲尔·桑索姆把它带到基因测序公司Illumina的实验室,路易丝·弗雷泽在那里工作……

路易丝:嗨,我是路易丝·弗雷泽。我在Illumina工作,我有一个团队专注于从人类血液样本和唾液样本中提取DNA。

菲尔:露易丝,我有个礼物要送给你。

路易丝:哇,这和我们平常收到的很不一样。通常我们会在无菌容器中接收样品。我现在看到的是一个果酱罐看起来装满了水。

菲尔:你要拒绝我的样品吗?

路易丝:不,我们总是很高兴收到各种样品

菲尔:你很老练,我要把这个给你。

路易丝:谢谢。它看起来确实像自来水,但里面有一些东西。

菲尔:现在我不会告诉你那个鱼缸里是什么鱼,但是你猜怎么着?

路易斯:我不知道,金鱼,或者一些非常大的锦鲤或鲤鱼?我不知道。从水里是看不出来的。

菲尔:先告诉我你们到底要怎么处理样品。

露易丝:我们这里有大约半升水,这个体积太大了,在实验室里很难处理。所以我们会把水通过过滤器来浓缩样本中的DNA。然后我们将溶解样本中的任何细胞物质,这意味着打开或打开细胞,将DNA释放到溶液中,然后我们就可以通过将DNA与磁珠结合来分离DNA,这样我们就可以很容易地提取DNA。

菲尔:除了水里的鱼,你还能找到其他东西的DNA吗?

路易斯:是的,我们会的。你会期望找到鱼缸里的微生物群例如,细菌可能喜欢生活在这些鱼缸里,知道这些细菌的序列可能有助于我们确定鱼是什么,我们可能会发现果酱罐里最初是什么东西的痕迹。

菲尔:哦不。

露易丝:那要看洗得怎么样了。

菲尔:如果你能找到果酱,弄清楚那是什么果酱的话。我会印象深刻的。

露易丝:不保证,我们先瞄准鱼,看看还能得到什么。

菲尔:那鱼吃的食物呢?你也想找到那个吗?

露易丝:我们可能会从中找到DNA序列。我不太清楚鱼食里有什么。

菲尔:你兴奋吗?

路易丝:我很兴奋。我很想看看结果,看看我们能发现什么。以前,我们能够对这样的样本进行深度测序,你只能寻找你知道存在的东西,但有了测序,我们可以寻找所有的东西,然后试着找出最初存在的东西。

菲尔:祝你好运!

路易丝:好的,非常感谢!

评论

添加注释