灭绝的终结?

科技的发展是否意味着某些物种的灭绝并不是终结?
7月22日

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毛茸茸的长毛象

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长毛猛犸象还会在苔原上游荡吗?本周我们的问题是,基因技术的进步是否意味着灭绝不再是终结,以及在永久冻土中埋藏了2000年后重新复活的苔藓,以及潜伏在南极洲冰层中的数百万年前的微生物。此外,我们的基因控制着我们和谁交朋友,海胆化石如何找到你丢失的车钥匙,以及古老的牙菌斑揭示了我们祖先的饮食……

在这一集里

朋友

00:53 -友谊取决于基因

基因不仅控制我们的外貌和我们可能患上的疾病:它们还决定我们选择和谁交朋友……

友谊取决于你的基因
詹姆斯·福勒,加利福尼亚大学

共同的兴趣爱好可能会让人们走到一起,但新的研究却能做到这一点朋友表明我们可能会选择与自己基因相似的朋友。

通过比较朋友和陌生人的基因,来自加州大学圣地亚哥分校的詹姆斯·福勒发现,我们与亲密盟友分享的不仅仅是我们的兴趣,正如他向克里斯·史密斯解释的那样……

詹姆斯:嗯,我们研究了人类基因组中不同的标记,发现朋友往往有共同的基因。事实上,朋友之间的相似性是如此之强,就好像那个和我们没有共同祖先的朋友是我们的四堂兄。更有趣的是,我们发现的一件事是我们和朋友共有的那些基因也是进化最快的。因此,这些因素加在一起表明,友谊一直在加速人类的进化。

克里斯:哇!那么,为什么从逻辑上讲,如果彼此是朋友,那么他们的共同基因会比你预期的要多呢?为什么会这样呢?

詹姆斯:嗯,我们知道朋友之间有很多相似的特质。在这种情况下,我们发现朋友有更多的基因是因为他们选择了彼此,或者他们被吸引到相似的环境中,在那里他们遇到了像他们一样的人。举个例子,假设你的基因让你非常非常喜欢咖啡。就像僵尸一样,你会被吸引到咖啡馆,你可能会发现其他同样被吸引到咖啡馆的人,那就是你交朋友的地方。

克里斯-你是怎么发现这个的?

詹姆斯:我们从弗雷明汉心脏研究中获取了大约2000人的信息,观察了他们的基因和友谊。我们比较了朋友之间的基因相似度和来自同一群体的陌生人之间的基因相似度。

克里斯:问题是,如果你看看我们倾向于与谁结婚、与谁发生性关系、与谁生孩子,我们总是被告知,人类正在进化,拥有最大的基因多样性。我们追求最大的差异。所以,如果你对那些选择伴侣而不是选择朋友的人进行研究,你会看到不同的关系吗?

詹姆斯:所以,你问这个问题很有趣。我们的一些同事最近发表了一篇论文,表明配偶也倾向于在基因上相似。但这隐藏了基因组的某些部分,我们往往是不同的。所以,一个长期存在的结果是,当你观察配偶时,他们往往有相反的免疫系统基因型。原因是,你不希望你的配偶容易受到你也容易受到的影响。你想让它们成为抵御疾病的额外防线。我们在友谊研究中也发现了同样的事情。你朋友的免疫系统基因型也往往与你相反。所以,有趣的是,我们在配偶和朋友身上都得到了相似的结果。

Chris -那么,从字面上看,你可以用我的基因,你可以从我周围的一群人身上做出预测,然后说我可能会和谁相处,或者不会?你能做到吗?

詹姆斯-是的,我们可以。这是验证我们发现的一种方法。我们采用我们的模型,我们观察所有相似的基因和所有不同的基因,以及我们的朋友。我们可以用它来取那些我们不知道他们是不是朋友的人的基因,然后做出预测。我们可以创造一个所谓的友谊分数。从低的友谊得分到高的友谊得分实际上增加了24%两个人成为朋友的概率。我真的很惊讶它会如此强大,因为我们知道社会环境对于决定谁和谁做朋友也很重要。但在这里,基因似乎也起着重要作用。

克里斯:那么,你认为为什么进化选择让我们被有相似基因组成的人吸引呢?你认为这就像“我有化学优势,喜欢咖啡,你也喜欢,因此,我们成为了朋友”那么简单吗?或者你认为实际上有更微妙的机制在起作用,使基因相似的人相互吸引?

James -我认为至少有一部分是主动选择我这么认为的原因是因为我们在研究中发现的另一件事是那些我们和朋友共有的基因,这些基因实际上进化得最快这表明这些基因也给了我们生存优势。以语言为例。如果你是第一个获得语言突变的人,这对你有任何好处吗,除非你和其他有同样突变的人有社会联系。这是一种基因变异,只有当别人拥有它时,它才会给你带来优势。这正是我们期望在整个基因组中发现的如果我们有这种关系你和朋友有多少共同的基因和这些基因进化的速度有多快。换句话说,我们似乎发现的一件事是,友谊实际上可能在某种程度上加快了人类进化的速度。

海胆

06:34 -在利维散步

世界上许多动物都以同样的方式寻找食物,这种狩猎行为的证据甚至存在于化石记录中……

走征途
大卫·西姆斯,南安普顿大学

如果你看不见或闻不到下一顿饭的位置,什么是最好的方法?

世界各地的动物,包括一些人类部落,都使用一种类似的觅食技术,叫做“lsamvy walk”,这似乎是寻找随机分散资源的最佳方式。

但这是什么时候演变的呢?这是人类第一次在化石记录中发现这种行走方式的证据,表明这种技术至少有5000万年的历史。

南安普顿大学的大卫·西姆斯告诉凯特·阿尼更多关于各种动物是如何行走的……

大卫:几年前,我们对鲨鱼、企鹅和金枪鱼等活体动物进行了一些研究,发现它们会移动,会以一种非常有特色的方式寻找资源。我们很想知道,这种模式是从哪里出现的?它会在数百万年前出现吗?我和一位古生物学家Richard Twichett合作,我们一起寻找化石来研究它,我们在西班牙北部找到了一些。

凯特:那么,你究竟如何从岩石中的化石中判断它们是如何移动的呢?

大卫:很明显,化石本身就是动物走过的化石痕迹。所以在我们的研究中,我们研究的是始新世时期的蠕虫类动物和海胆;大约五千万年前。所以,保存下来的是它们的运动轨迹。当它们移动沉积物时,就会留下这样的痕迹。所以在我们的实验室里,我们研究海洋捕食者的运动生态学。我们使用统计方法从电子标签数据中提取模式。因此,我们所做的就是利用这项技术,分析这些灭绝动物的化石痕迹。

凯特-告诉我你发现了什么。这些史前灭绝的动物是如何在沙子里扭动的?

大卫:嗯,我们发现,当你用不同的方式描述时,动物们就会扭动。一些蠕虫状的动物以所谓的自我避免随机行走的方式移动。所以,它们避开自己的路线,转移到可能有觅食机会的地方。我们从蠕虫类动物身上发现,它们倾向于做螺旋状运动。但有趣的是,对于已经灭绝的海胆来说,它们的运动模式聚集在3到4个不同的尺度上。想象一下,在人类的环境中,我们在办公室里进行搜索,但是我们找不到,所以我们在我们的机构或家里进行搜索。如果我们找不到,我们就在我们的镇上搜索一下。所以,在每个尺度上,图案看起来都是一样的。所以,这就是为什么它很有趣的原因,因为这就是理论上所说的,至少是一个拉西步。

这也是今天海洋生物寻找食物时的做法。

大卫:对,是的。几年前,我们在《自然》杂志和《国家科学院学报》上发表的几篇论文中已经表明,像信天翁、姥鲨、大眼金枪鱼和企鹅这样的鸟类,它们的运动模式都非常接近于这种最优模式,即l行走模式。当然,lsamvy walks很有趣,因为我们展示了动物,活着的动物也在使用它们。这很有趣,因为如果你想寻找稀疏分布的资源,从理论上讲,lsamvy步行是一种最优的运动模式。所以,想象一下,你不知道资源在哪里,你没有一个很好的地图去哪里找东西,你不太了解你的环境。所以,这是最好的移动模式。事实上,也有人类表现出这种运动模式。就在最近,有一项关于坦桑尼亚北部狩猎采集者的研究他们也采用了这种lsamvy步行方式。所以,这似乎是-当你不知道东西在哪里的时候,lsamvy步行是一个很好的近似方法,你应该做的是快速找到资源。

人类寻找食物的方式,信天翁和企鹅寻找食物的方式,以及数百万年前这些微小的海洋生物都以同样的方式寻找食物。这告诉我们这是一种非常古老的寻找方法,不是吗?

大卫:没错。证据表明这是一种非常古老的模式。我的意思是,很明显,我们只研究了——我说的只是——我们只研究了5000万年前的动物。但事实上,我们看到的一些模式,我的意思是,我们有一个白垩纪的化石,它是七千万,八千万到一亿四千万年前的。所以,它把它往后放了一点。所以,如果这种运动模式,如果它有某种内在的模式,某种动物天生的模式,那么当然,这可能意味着它有一个很长的起源。

所以,如果我在找巧克力或我丢失的钥匙,我可以感谢数亿年的进化帮助了我。

大卫:没错。这是寻找某种东西的最佳方式,我们想象这个问题在几千万年前,甚至几亿年前就已经解决了。

月亮

12:01 -超级月亮

许多人会注意到最近月亮看起来特别大,特别亮。这是因为一种被称为超级月亮的现象。

晚上的

当满月与月球运行到的离地球最近的点重合时,就会出现超级月亮。它们大约一年发生一次。

月球的轨道不是圆形的,而是椭圆形的,这意味着它与地球的距离可能在35.7万公里到40.6万公里之间。

当月球在它最近的点,即近地点时,它看起来比它最远的点,即远地点大14%,亮30%。

视错觉是指月亮在地平线上的时候总是看起来更大,所以当它升起的时候,它看起来会特别令人印象深刻。

月球在地球上产生潮汐,因为它的引力对地球最靠近它的那一面的引力更大。由此产生的潮汐既可以在海洋中看到,也可以在上下移动达半米的岩石中看到。

月球现在离地球更近,这一事实将对潮汐产生影响——尽管影响很小。潮汐最多可能会高一英寸,但对我们人类来说,这种差异可能不会明显。

下一次超级月亮将在8月10日,在格林尼治标准时间晚上7点出现。这将是地球一年中最接近月球的时刻,所以值得关注。

13:57 -老年痴呆症的危险因素

一项新的研究表明,多达三分之一的阿尔茨海默病可以通过更健康的身体来预防。

阿尔茨海默病的危险因素
Carol Brayne,剑桥公共卫生研究所

阿尔茨海默病仅在英国就影响了大约50万人,还有这个老年痴呆症老年斑预计随着人口老龄化,这一数字将会增加。

然而,本周剑桥大学的一个研究小组表示,只要改变我们的生活方式,多达三分之一的病例是可以预防的。他们确定了几个可能增加患这种疾病可能性的风险因素,其中一些因素可以简单地归结为生活方式的选择。

Ginny Smith采访了Carol Brayne,了解这些危险行为是什么……

卡罗尔:那么,风险因素,它们贯穿整个生命过程。因此,有教育,缺乏运动,吸烟,有中年高血压,中年肥胖,糖尿病,然后是抑郁症。单独来看,研究表明这些都与风险增加有关。现在,如果你把它们放在一起而不考虑它们之间的关系你可能会认为我们可以预防二分之一的阿尔茨海默病。但事实上,当然,它们都有明显的联系,它们在整个生命过程中都起作用。当你把它们放在一起的时候,大约是三分之一。

金妮-我们知道这是怎么回事吗?为什么体育活动如此重要?为什么还有其他的风险因素,为什么它们是风险因素?

卡罗尔:目前对这些风险因素进行了大量的研究。我们试图梳理出这种保护可能存在的原因。它发生的原因有很多。这可能是因为我们身体的细胞以不同的方式工作如果我们身体非常活跃和健康,但它也可能是神经元放电和相互交流的方式,以及为我们的大脑提供血液和含氧血液的血管,它们可能以更好的方式工作,它们可能更有效。所以,这是关于整个身体的健康,包括大脑。

金妮:现在,你谈到的一些风险因素显然是在人们的控制之下的——多做运动,戒烟,诸如此类,但你也提到了抑郁症。对我来说,这似乎不像是一种生活方式因素。你不会选择得抑郁症那么为什么抑郁症也属于同一类别呢?

卡罗尔:之所以在这个分析中,是因为在最初的研究中,它被认为是一个风险因素,并且被一次又一次地证明与痴呆症有关。有一种感觉是,在社会中对抑郁症采取措施是可能的。在某些情况下,人们更容易抑郁,但也有有效的治疗方法。所以,我们不知道治疗抑郁症患者是否会在以后出现明显的痴呆,因为这是另一种类型的研究。但我们确实知道抑郁与老年痴呆症有关,有有效的治疗抑郁症的方法,也有某些社会条件会加剧抑郁症。

金妮:那么,你说三分之一的病例是可以预防的,这意味着有些人可以做所有正确的事情,做所有的运动,不吸烟,仍然会得老年痴呆症。这一切都归结于基因还是还有其他我们还不了解的因素?

卡罗尔:对于人群来说,年龄是最大的风险因素,很明显,在人群中有一些群体基因起着重要的作用。对于这些人来说,可能会有药物治疗,特别是干预措施,在未来可能会起作用。但对大多数人来说,问题将是年龄。因此,很难说我们会阻止第三次。我认为更直接的说法是,我们会在特定年龄降低患病风险。因此,我们确实有一些来自英国的证据表明,我们可能降低了在特定年龄段患痴呆症的风险。这并不是说如果你做了这些事情,你就不会患上痴呆症。它更多的是关于我们,在特定的年龄降低我们的风险因为在这些风险概况中,如果我们作为一个社会参与更多的体育活动,少患糖尿病等等,那么当然,我们都会活得更久。这意味着我们变老了,因此,我们有很大的风险。只是如果我们能健康地活到65岁,我们有更大的机会拥有一个更健康的晚年,在我们死前衰退的时间也会更短。

人类的牙齿

17:57 -古老的牙菌斑

为什么即使在农业出现之后,一群古人类还在大嚼一种味道相当难闻的杂草?

古代牙菌斑
与巴塞罗那大学的卡伦·哈迪合作

饮食在人类历史上一直是一个重要的因素。但是,看
人类的牙齿随着时间的推移,我们越来越难以知道我们的祖先吃什么,尤其是在农业出现之前。

然而,一个线索可能存在于古代骨骼牙齿上的牙菌斑中。格雷哈·杰克逊采访了巴塞罗那大学的凯伦·哈迪,以了解这些咬人动物能告诉我们的更多信息。

凯伦:我们正在研究的样本来自苏丹中部。这是一个考古遗址,涵盖了大约9000年的时间跨度,从农业出现之前,到农业的发展和引入,再到新石器时代晚期,直到现代开始。挖掘人员联系了我,他们问我是否可以看看牙结石的样本,看看我们是否可以降解这些样本,并确定人们吃了什么。

Graihagh -当你说微积分的时候,你指的是蛀牙,蛀牙。

Karen -不,不是蛀牙,是牙菌斑。如果你不清洁牙齿,你就会有一层粘稠的膜,当你去看牙医的时候,他们就必须把它刮掉。所以,在大约两周的时间内,牙菌斑,如果没有被清除,就会钙化并变硬。然后它会在牙石中保存摄入物质的证据。

Graihagh -那么,你到底发现了什么?这块匾里装的是什么?

凯伦:那么,举个例子,在这个案例中,有一种非常非常明确的迹象,叫做罗通定,它存在于紫色的胡桃草中。这种植物在亚热带地区非常多,事实上,它被认为是一个真正的麻烦,因为它传播得非常快,很难消灭。今天,它被用作动物饲料。然而,从历史上看,它被用作食物来源,作为药物来源。它被用作香水,也用于水净化。

Graihagh -你看到了相当长的时间尺度,从狩猎采集者,一直到农民,他们一直在吃这种紫色的胡桃草。通常,当你看到从狩猎采集者到农民的转变时,你通常会看到他们吃的东西的转变。那么,你认为他们为什么继续吃这种紫色的胡桃草呢?

这种植物也有抗菌的特性。有可能他们认识到并知道了抗菌的特性,并利用了这些特性。当然,我们不能这么说。我们不知道他们为什么吃它,但我敢肯定,吃它的主要原因是作为碳水化合物的来源。

Graihagh -你所说的这些抗菌特性,是否意味着他们的牙齿比正常情况下更好?

植物生物学家的一些研究表明,这种植物可以抑制变形链球菌。然而,我们不能直接下结论说农耕时期的人牙齿更好,这是有可能的。

Graihagh -这些研究让我震惊的是,以前很多人都关注蛋白质,但对蔬菜和其他饮食元素的关注并不多。这些技术是如何改变我们看待祖先的方式的?

凯伦:我们对狩猎采集者饮食的了解有很大的差距,因为没有证据。有证据表明植物往往很快就会分解,而且这种情况非常罕见。我认为这种类型的研究无疑为我们打开了一扇窗,让我们可以从更广阔的角度来看待农业前,也就是过去的狩猎采集者饮食。

毛茸茸的长毛象

21:58 -带回长毛象

像《侏罗纪公园》中那样,一个古老物种的复活真的有可能吗?

把长毛象带回来
与哈佛大学的乔治·丘奇合作

1993年的大片《侏罗纪公园》在电影银幕上爆发,票房近10亿美元,吸引了数百万人的想象力。

但是像这样一个古老物种的复活真的有可能吗?

2003年,一种名为Bucardo的野生山羊的最后幸存成员在它去世后被成功克隆,使该物种成为有史以来第一个“去灭绝”的例子。

这一成功是短暂的,克隆人在几分钟后就死了,但把动物从历史书中带回来的想法已经引起了人们的关注毛茸茸的长毛象许多科学家的想象力。

哈佛大学的乔治·丘奇就是这样一位科学家,他希望把我们的侏罗纪公园梦想变成现实,他带回的不是危险的恐龙,而是温和的巨人——长毛猛犸象,他向凯特·阿尼解释道。

乔治:所以,我们非常感兴趣的是达到现代生态系统,这可能有利于人类的生存,并减少适应成本,在这些现代生态系统中,各种物种的生存。反过来,我们有理由相信猛犸象可能很好地适应了极端寒冷,具有讽刺意味的是,在全球变暖的西伯利亚和加拿大,极端寒冷仍然存在。

凯特:那么,你想看猛犸象在西伯利亚苔原上自由漫步吗?

乔治-或者至少是抗寒的大象。

凯特-我们说的是什么生物?我们说的是100%猛犸象还是介于两者之间的某种混合体?

乔治:几乎每一种动物都是与邻近物种杂交的。所以,这里真的有一个关于纯洁的神话。但我认为重要的是,现代生态系统需要现代的解决方案,我们希望利用任何我们能从最近灭绝的物种中得到的启发来帮助我们维护现代物种,例如,亚洲象遇到了很大的麻烦,因为它被人类包围了。所以猛犸象是亚洲象的近亲。所以,如果你能把它们中的一些隔离在人类很少的地方,这可能对它们和苔原都是有利的。

凯特,给我们简单介绍一下猛犸象的历史。猛犸象是什么时候灭绝的,你如何获得它们的DNA来重建它们?

乔治:所以,他们大约在一万到五千年前灭绝了。随着冻土带的融化,越来越多的冰变得可用。所以,它们的DNA仍然处于可怕的状态,因为宇宙辐射,如果没有其他因素的话,在这1万年甚至4万年的时间里,对一些标本来说。但是我们可以恢复这个DNA,它被分解成一种扁平的碎片,用决定性的化学结构对它进行排序,这是我的实验室和其他人最近开发的一套新技术。

凯特:你是怎么把这个DNA序列,你从冰冻猛犸象身上挖出来的DNA转换过来的?你怎么把它变成一只活生生的长毛象?

乔治:那么,另一套技术,这应该意味着读取我们现在合成的古代DNA,然后用一种叫做CRISPR的新方法将我们想要的DNA插入哺乳动物体内。它大约有一年半的历史,主要用于基因治疗,但对农业物种也很有用,现在对这些野生物种也很有用。它只是在DNA的一个地方——大海捞针——非常精确地切割,就像在一头的位置,然后我们将用大象干细胞中的旧DNA替换新DNA,这个干细胞最终能够产生一个完整的婴儿。

凯特:所以,你基本上是把DNA切碎并改变了,所以你得到了一些猛犸象的DNA,一些大象的DNA。那你大概得找个大象代孕妈妈。我是说,大象有多擅长做替身?

乔治:我的意思是,这看起来很像一只正常的小象,除了多余的毛发,甚至毛发也可以推迟到它们相当成熟的时候。

我有一个想法,就像一只母象说:“什么?那是什么!它一点也不像我。”

乔治:是的,我认为他们倾向于珍惜——你知道,你听过这样一句话,“只有母亲才会爱的脸”。

凯特——一只只有妈妈才会爱的猛犸象。我是说,这里离我们有多远?我幻想着成群的猛犸象自由漫步。你认为这要多久才能成为现实?

乔治:所以,很难给出一个确切的日期,但技术发展很快。这是一种指数级的进步,因为人们对医疗保健对人类的好处感到兴奋。它是向下移动的,所以我们能做的最快的事情是如果需要少量的改变来让大象开始抵抗寒冷,它可能需要几年的时间,然后需要22个月的时间才能出生。所以,这是它能达到的绝对最快速度,之后可能还会更快。

凯特-所以,要等一段时间。但是你知道,对于大象和猛犸象,很容易看出它们之间的关系。你还关注其他物种吗?你是要像斯皮尔伯格那样对我们吗?

乔治:嗯,我可以为自己说话,这是我实验室议程上唯一的一个。例如,我尽量避免食肉动物,“复兴与恢复”有一个庞大的社区,正在研究其他濒临灭绝的物种。我们正在引入古代DNA来帮助增加它们的多样性,包括其他最近灭绝的动物,比如美洲东海岸的健康母鸡。

凯特:所以,如果我们能找到猛犸象,让它们复活,简单地说,你认为它们会如何丰富苔原和这类地方的多样性?他们有什么好处?

乔治:生态学家谢尔盖·齐莫夫(Sergey Zimov)等人写了几篇论文,描述了猛犸象是如何通过戳破积雪,让春草从枯死的冬草中冒出来,把树推到一边,让草生长,从而降低平均气温的。因此,总的来说,导致冻土带的稳定融化,释放出二氧化碳和甲烷等温室气体,这是一个惊人的数字,它们的总量大约是世界上所有森林中碳总量的2到3倍。所以,如果我们让它通过融化从苔原上逸出,就像我们烧毁了世界上所有的森林。所以,即使我们不相信温室气体的其他来源,这也是我们真正需要关注的。

克里斯-乔治,你认为将来有可能完成猛犸象的完整基因组吗?所以,与其把大象的正确片段和猛犸象的一些基因混合起来,你认为我们是否能够获得整个猛犸象的基因组,并看到真正的猛犸象?

乔治:我认为,如果我们在研究抗寒大象方面取得进展,那么成本似乎会像我认为的那样大幅下降。我们有这个能力。我们知道做它的基本方法。现在的问题是把价格降到一定程度,从环保的角度探索可行性。但是,是的,我认为根据我们今天所知道的,这是非常可行的。

29:07 -反灭绝是保护计划B吗?

随着地球正处于第六次大灭绝事件中,“反灭绝”是否能为我们正在失去的物种带来任何希望?

反灭绝是保护计划B吗?
与伦敦大学学院和伦敦动物学会的凯特·琼斯合作

猛犸象在4000多年前就灭绝了,那么无数的
伦敦动物园的小老虎由于气候变化、栖息地丧失和狩猎,我们今天正在失去的物种?反灭绝会是一个有效的“B计划”吗?乔治亚·米尔斯去伦敦动物园一探究竟……

乔治亚州——说了这么多让猛犸象起死回生的话题,我想知道自然资源保护主义者对猛犸象灭绝的可能性会有什么反应。动物园目前是保护地球野生动物的主要参与者之一,所以我去了伦敦动物园,去看一些最新到来的动物——3只苏门答腊虎幼崽。野生苏门答腊虎仅存300只,这些幼崽将在拯救该物种免遭灭绝的斗争中发挥关键作用。伦敦动物园的丽贝卡·布兰查德告诉我更多。

丽贝卡:这些幼崽将在苏门答腊虎的未来中扮演重要角色。不仅帮助我们从来动物园看它们的人们那里筹集资金,还提高了人们对我们正在做的保护工作和这些动物的保护状况的认识,帮助我们谈论它们的重要性。过去几年,老虎一直是我们关注的重点。真正发展我们在印度尼西亚的保护项目,这些项目都是基于兽医工作,努力减少栖息地的丧失,反偷猎巡逻队也在那里。因此,我们正在做各种各样的工作。

乔治亚州——由于野生苏门答腊虎已经所剩无几,自然资源保护主义者正在努力防止它们重蹈近亲巴厘岛虎的覆辙,巴厘岛虎在上个世纪消失了。但是,最近有人声称动物可以从灭绝中复活,这对我们拯救地球当前多样性的斗争意味着什么?我遇到了伦敦动物园和伦敦大学学院的凯特·琼斯教授。

凯特:最近有很多炒作说,也许灭绝并不像我们最初认为的那样永远。在过去的几年里,合成生物学技术有了巨大的发展,所以使用更精细的技术来操纵基因组,要么将古老的DNA拼接在一起,要么将DNA植入细胞中,这样你就可以操纵细胞中的DNA并创造出其他东西。所以,这是一种通过操纵基因组来制造新生物体的方法。

乔治亚州——所以,有人声称人们可以带回一些物种,比如长毛象或袋狼。你认为这些说法是现实的吗?

凯特:我不知道未来会发生什么,但现在还很遥远。如果你想象一下长毛象的基因组,你从长毛象身上得到一些古老的DNA,你得到一些DNA,然后对它进行排序。想象一下,你有一个图书馆,你把书撕成很小很小的碎片,扔到空中。你挑选的是那些DNA片段。所以,无论如何,你必须从地板上的这些碎片中重建一个完整的图书馆。这就是我们对猛犸象DNA的研究。所以,有测序工作,但最终,你会得到一段DNA,然后从一段DNA创造一个细胞到拥有一头猛犸象,这是一件巨大的事情。所以,这些步骤是相当大的,如果我们能做到的话,这将需要很长时间。

乔治亚州-我想这项技术会非常昂贵。你觉得这会转移像伦敦动物园这样的地方急需的资金来保护我们仍然拥有的物种吗

凯特:我认为人们很容易随波逐流,以一种非常消极的方式来应对灭绝。所以,我想自然保护生物学家已经说过这是不值得的,这是浪费钱。但我认为合成生物学社区将会继续存在,不管我们喜欢与否,人们都会努力思考如何将其用于工业,他们无论如何都会这样做。所以,我认为更聪明的方法是考虑如何最好地利用这些技术来帮助保护环境,而不是一味地说,“这很糟糕,这是在浪费钱。”与这些人合作,思考如何最好地利用这些技术来保护环境,可能更聪明。例如,苏门答腊虎是极度濒危的物种,也许应该更好地利用合成生物学技术来帮助它们的保护繁殖计划,以更好的方式从灭绝的标本中恢复一些遗传多样性。想想去灭绝物种,这真的很酷。在恢复灭绝的过程中有一种新奇的因素。如果失去了那就太可惜了。我会环游世界去看猛犸象。因此,吸引媒体和公众注意的一种方法可能是让一些已经灭绝的亚种重新灭绝。 So, for the tigers, maybe that would be the Balinese subpopulation you could put efforts into helping recreate that. And that would add in to the genetic diversity of the entire species. So, I'm not advocating that, but I'm just saying that's an example of how we could be a bit more smart and less reactive against these ideas which are coming up.

Georgia -那么,你认为如果他们带回像巴厘岛老虎这样的东西,会不会更像是一个噱头,而不是真正的科学努力?

凯特:你必须非常仔细地考虑你为什么要进行物种恢复。是将物质重新释放到自然环境中,这意味着你必须有一个自然环境来释放它。人们认为长江豚在过去几年里已经灭绝了。即使你可以把它带回来也没有任何意义因为没有地方可以放它。所以,你只是把它带回来作为动物园里的一个小标本供人们参观吗?我确信这会增加收入,但这真的是节约吗?但如果你这样做了,但如果你有一个相关的保护重新引入计划,或者把增加的兴趣所产生的钱投入到其他极度濒危的物种中去。因此,将令人惊叹的因素与一些物种保护项目的实际帮助结合起来,可能是前进的方向。另一件非常有趣的事情是利用合成生物学在其他方面帮助保护环境。因此,患这种白鼻真菌病的北美蝙蝠数量大幅减少。 Perhaps if we could think about manipulating the genomes so that they're resistant to these species would be really cool or manipulating a tree so that it scrubs more pollution out of our atmosphere from where I work in Central London would be awesome.

乔治亚州——很多人听了会认为,把死去的东西复活是在扮演上帝。你觉得我们有什么理由不能这么做吗就因为他们走了,他们有过机会,我们就该顺其自然。

凯特:我认为这些都是非常有趣的问题,我也没有答案。你也可以反过来说,是我们首先让它们灭绝的。如果它们是自然灭绝的,那很公平。巴厘虎的亚种群因为我们的猎杀而灭绝。袋狼也是如此,这就是它灭绝的原因。我们留下了什么样的遗产,我们肩负着什么样的责任?我认为这些都是非常有趣的伦理问题。

南极洲的锡尼岛苔藓滩

36:36 -永冻土中有两千年的苔藓

苔藓在南极洲被冻结,2000年前解冻后开始生长。

永冻土中有两千年的苔藓
英国南极调查局的彼得·康威

而科学家们正在努力带来像猛犸象这样的灭绝物种复活了,一些我们认为已经永远消失的东西可能没有我们想象的那么死。英国南极调查局的彼得·康威(Peter conway)和他的同事们通过研究古苔藓来研究气候变化,但当他们向凯特·阿尼(Kat Arney)和克里斯·史密斯(Chris Smith)解释说,就像电影《小精灵》(Gremlins)一样,他们只是简单地加了水时,他们感到惊讶……

彼得:苔藓给了我们很好的气候记录,在南极的一些地方,苔藓已经在一个地方生长了几千年,我们所知道的最古老的苔藓群已经有5000年了。它们的不同寻常之处在于,苔藓生长在地表。它们的顶部是绿色的,每年它们会长出几毫米的绿色生长物。但如果你喜欢的话,茎会留在它们下面。最终,在南极洲,你会得到2到3米厚的苔藓,下面是20厘米,它会进入永久冻土层,因为南极的环境非常寒冷。一旦它进入永久冻土,它就会在静止状态下有效。我们对苔藓库的岩芯进行定位因为它们告诉我们数百或数千年前苔藓活跃生长时的气候是什么样的,这是我们的主要兴趣。但我们看了这些苔藓核,它们实际上看起来保存得很好。茎看起来保存得很好,叶子看起来保存得很好,即使从细胞层面来看,细胞壁也完好无损。它们看起来一点也不严重。 So, we simply thought, how far down a moss core might it be possible for the moss to recover? We started out with, figuring the literature on the subject suggests a small number of decades. That's the sort of the time span the people have managed to get mosses to regrow from. But we got a core out that covered about 1600 years and we divided it into sections and put it in a plant growth incubator very simply. As you said, just added water and gave it some light. And lo and behold! We did get some shoots growing right through the depth of the core.

凯特-当你打开盖子的时候一定很震惊,哎呀,它变绿了!你怎么知道那一定是非常非常古老的1600年植物才恢复生命?你怎么知道肯定是他们?

彼得:我得说,这既令人惊讶又令人愉快。你有一种即将发生的感觉,当它发生的时候感觉很好。如果你仔细观察,如果你把核心表面放在显微镜下,你会看到那里的老芽,然后新的芽正在生长,很明显是从老芽中生长出来的。它们非常牢固地附着在它们上面如果在我们钻出核心的时候有污染孢子或者植物碎片就不会这样了。所以,我认为我们很有信心,新的增长来自于这个深度,这个核心的年龄。我们对这个时代充满信心。它在放射性碳测年的范围内。我们对年代很有信心,因为我们有很多保存完好的碳基岩心材料来确定年代。

凯特:所以,这些苔藓是最后的绿色和叶子,大约在罗马帝国结束的时候。你能让它们再次生长真是太神奇了,但这不仅仅是“哦!这太酷了!”它能告诉我们什么?

彼得:公平地说,这是一个蓝天问题,事物能存活多久?但是发现它们可以存活,它告诉我们,例如,如果你有一块土地,一块苔藓的区域被冰覆盖,冰会在一个世纪或千年的时间尺度上膨胀和收缩。那么你就有可能在它们所在的地方生存下来,而不是——我们过去总是认为,当冰出现时,它下面的一切都被消灭了。如果不是这样,那么生物或生物多样性就会存活下来。下次冰消退的时候,你就有可能重新在这个地区定居,以不同的方式了解这个地区的生物多样性。

凯特:你提到这些苔藓,它们已经有1600年的历史了,你说:“我们认为它们可能有几十年的历史。”与我们所知道的其他一些可以进入停滞状态然后恢复的动物相比,这是什么呢?

彼得:嗯,这是一个开放性的问题。在这种条件下生存的能力被称为隐生,也就是在长期冰冻或长期干燥条件下生存的能力。当你有一个动物或植物,甚至是一个微生物细胞处于这种状态时,你或我看着它,我们无法做任何事情来告诉我们它是活的。我们得把它放回正常状态,看看它能不能站起来,能不能走开。

现在,有许多无脊椎动物群体最著名的是缓步动物和线虫,还有一些螨虫,一些弹尾虫,甚至一些昆虫,它们可以存活的时间和我们认为的苔藓可以存活的时间相似,所以10年,20年,30年,这样的顺序。有一件事我们还没有对这些核心做过,那就是看看是否有任何被控制的动物,或者我们是否有办法让被控制的动物复活。这是一个完全可行的问题。只是我们一直没机会这么做。

Kat——蚂蚁的侏罗纪公园。

彼得:是的,小多了。里面没有恐龙。

凯特-这太迷人了。我们在上周的节目中谈到了将人类送上月球的问题。如果你能把一些植物以干燥的静态形式带走,这将非常有用,如果我们要去地球化或殖民其他星球。

彼得:当然,这是一种携带物品的方式,重量更轻,也更容易保持原状。我的意思是,现在我想这有点像科幻小说。但我们确实知道地衣,这是另一种——它们不是植物。它们是藻类和真菌的共生,但它们在极地和极端环境中也很常见。我们知道,你可以把整个地衣或地衣的孢子带到空间站上,它们可以在太空条件下生存。所以,是的,潜在地,这些群体可以发挥作用,我们称之为地球化,或者至少为太空舱环境提供氧气。

凯特:简单地说一下,如果你把这些苔藓种在外面,它们又会怎样呢?他们会没事吗?

彼得:基本上是的。我的意思是,它们是极地物种,所以它们能很好地适应寒冷的环境。但是有一种物种我们可以这样做,或者我们在南极有一种物种实际上出现在北极,它出现在苏格兰的山上。我认为在塞特福德森林甚至有一个非常接近的亲戚。所以,原则上,你可以把它放在至少不是阳光明媚的地方,而是一个凉爽、潮湿的地方,这样它就会很快乐。

所以,也许有一天,我们会看到乔治·丘奇的长毛猛犸象吃你修复的苔藓。

彼得:我们得种很多,不过是的。

克里斯-彼得,你们有没有对苔藓做过基因分析,看看底部的东西是否与1600年前的东西相似?

彼得:直接的答案是否定的,但这是一个我们正在研究的问题。我的意思是,观察在这段时间里是否有任何基因甚至生理生化变化是非常有趣的因为如果1600年前的情况不同。你可能会认为存在不同的基因表达或不同的生理适应。

Chris -我们采访了一位女士,很久以前,她在一个考古遗址中发现了一些枣核,这些枣核是几千年前在现在的以色列地区有人吐出来的。她能够让它们发芽,并从它们那里得到枣,但她说这些植物看起来确实与现在生长的植物有细微的不同。让我震惊的是,你的苔藓可能是在这2000年里随着茎的生长而进化的。

彼得:很有可能。这是一个非常公平的方法。这是我们想做的事情,我们正在努力做到这一点。

冰山

43:56 -冰里有百万年的微生物

当细菌或病毒灭绝时,这通常是一件值得庆祝的事情,但我们能确定它们已经消失了吗?

冰中存在了数百万年的微生物
与蒙大拿州立大学的约翰·普瑞斯库合作

当细菌或病毒,如天花,灭绝时,这通常是一个庆祝的理由,但我们能确定它们已经消失了吗?最近,科学家们发现,在长达一百万年前的南极冰层下,隐藏着完整的细菌群落。克里斯·史密斯采访了蒙大拿州立大学的约翰·普里库,普里库告诉他他们是如何发现这些微生物群落的……

约翰:几年前,我们钻的最深的样本有800米深。我们花了3天的时间,用一种特殊的钻头把雪融化,然后把雪加热到95摄氏度,然后把它射出一架喷气式飞机,我们把它放低,穿过冰,打了一个直径50厘米的洞,这个洞保持开放了大约2天。因此,我们昼夜不停地取样,收集冰盖下的水,并将其带到地表进行实验。

克里斯-当东西有800米深的时候,那是多久以前的事了?

约翰:靠近冰原底部的冰可能有一百万年的历史了。这是在南极洲,最古老的冰大约有一百万年的历史,所以这是我们星球上最古老,最原始的水。

克里斯:你对冰里的生物特别感兴趣吗?

约翰:没错。到目前为止,南极大陆一直被描述为地球上没有生命的一部分,我们正在努力做的一件事就是改变这种观念。我们试图证明在冰内和冰下存在着生态系统。

克里斯-这些是微生物群落,微小的微生物?

约翰:没错。冰下和冰里的环境都相当恶劣。没有太阳能来驱动光合作用。所以,那里真的没有植物。所以,生物体必须通过获取能量来生存。我总喜欢叫它"他们在吃石头"所以,它们实际上是在开采岩石来获取能量。那里的温度在零度以下。它们的温度大约是- 0.5到- 2摄氏度它们承受着相当大的压力。所以,那不是一个适合居住的好房子。

克里斯-这些生物是真的活着还是处于一种假死状态?

这个问题我们已经讨论很久了。当我们穿过冰层,取下岩心,观察里面的生物,我们可以把冰融化,生物就会复活。真是太神奇了。我们做过的最古老的可能是50万年的生物在一两分钟内就会进行新陈代谢。所以,我认为固态冰盖中的生物可能处于某种休眠状态。它们是一种等待液态水的生物而当我们进入冰盖下碰到液态水口袋时,这些生物确实有生命的长生不老药,如果你想要的话,那就是液态水。所以,我们最近做的工作是对冰下的水进行采样,我们把它带到表面,这些生物是活着的,生活在冰盖下面。

克里斯-跟我们说说你在海底发现的生物吧?它们是什么,为什么它们能在这种不可思议的环境中存活数万年到数十万年?

约翰:这些生物都是单细胞细菌。我们看到那里有一个生态系统,生物利用矿物质作为能量。我们看到另一组细菌可以以它们为食。这就是我所说的生态系统。我们在这里看到的是相互补充的生物体。这些单细胞生物非常善于在冰冻和解冻中生存。如果我把手指放在冰箱里冻了又解冻了几次,那可不是件好事。它会起泡,变黑,可能会掉下来。但是一个微生物,你可以冷冻和解冻,冷冻和解冻很多次,它们就很好了。

Chris -你认为它们可能是潜在的病原体对人类构成威胁吗?当我们融化冰或者冰因全球变暖而融化时,它们可能会出来并构成威胁吗?

约翰-我们已经清楚地考虑过这些生物作为病原体释放到地面的后果。当然,作为病原体,我们必须对这些病原体有免疫力才能生存。现在,如果一种生物长时间不与人类接触,人类就会失去这种免疫力。所以,我们要观察平衡,看看人类是否已经失去了对天花的免疫力比如说,天花可能是一种病毒,但如果我们在冰中看到炭疽细菌或其他致病生物,如果我们仍然保持对这种生物的免疫力,我们应该没事。但如果出现了我们已经失去免疫力的疾病,我们就得担心了。

我们想过把冰样本送到疾病控制中心进行筛选,但我们只研究了100万年的历史,这对生物体来说是一个很小的进化窗口。事实上,我们现在已经培养了很多这样的生物,并研究了它们的测序数据,我们没有看到任何真正奇怪的东西,也没有看到任何真正致病的菌株。然而,如果我们看看冰原本身——现在,我说的是底部的东西,但如果我们看看冰原本身,我们有一段关于地球的历史可以追溯到100万年以前。所以表面的物质是年轻的。随着我们越陷越深,它变得越来越老,越来越老。所以,当我们回到100万年前,我们才刚刚开始研究这类科学。但如果我们能对这些生物的DNA进行排序,我们也许就能追踪炭疽的流行以及导致欧洲鼠疫的生物,以及类似的事情。我们希望在未来的5到10年里,随着我们的测序方法变得越来越好,我们能够做到这一点。

亚洲象

需要什么样的DNA才能使一个物种复活?

乔治·丘奇(哈佛大学)——嗯,简单的回答是,我们不知道。但我们认为,如果目标是恢复部分基因组并使其适应新的环境,那么无论如何,旧的基因组都需要改变。关键是,你的基因组有多接近在猛犸象的例子中,它们非常非常接近亚洲象。它们彼此之间的距离都比它们与非洲的距离要近。所以,我认为这是最好的情况,相对较少的变化可能需要使它们适应寒冷。

我们能克隆任何灭绝的物种吗?

乔治·丘奇(哈佛大学)——克隆在大多数情况下是不可能的,因为它们没有被妥善保存。如果它们没有被妥善保存,它们的DNA就会断裂,它们就不能像我们之前谈论的苔藓和细菌那样存活。如果它们不能存活,那么你必须把它们读到电脑里,然后把它们重新打印到一些现存的物种中,把这些现存的物种变成一个古老的物种。

克里斯·史密斯-彼得,你认为同样的问题也适用于植物吗?我们能从你的发现中得到一些关于植物的信息吗?

彼得·康威(英国南极考察队)——同样的问题也存在,如果有什么东西真的死了,那么随着时间的推移,DNA片段会逐渐消失。所以,你的材料越老,你就越不可能得到很多可以克隆的材料。所以,有了我们一直在谈论的东西,你就有可能拥有一个保存很长时间但可行的DNA序列,也就是说,没有受损的DNA序列。如果是这样的话,那么我们确实有能力把东西带回来。

肾脏-这些实际上是羊的肾脏,不是人的肾脏,但这些可以作为说明的目的…

我们需要多少身体来维持生存?

格鲁吉亚-剑桥大学医学院学生Elena Teh帮助我们找到了答案。

埃琳娜:很多人都有很多器官,比如肾脏和肝脏被切除。现在答案要复杂得多我们有非常聪明的机器可以像心脏一样把血液泵到全身,像肺一样把氧气输送到血液中,像肾脏一样清理血液。

乔治亚-但是如果没有这些机器,我们身体的哪些部分是我们离不开的呢?

埃琳娜:首先,我们需要大脑和脊髓正常工作。它们控制着我们的呼吸和心率。主要是我们大脑的底部在做这些事情。所以,从理论上讲,我们可以切除控制我们个性的额叶,但仍然没事。我们还需要心脏将携带氧气和其他营养物质的血液输送到身体的其他部位。然后我们需要我们的肺,或者更确切地说,“一个肺”。我们真的只需要一个好肺就能活下去,但万一有两个也挺好的。我们还需要肝脏来处理所有进入我们身体的药物和毒素,但只是其中的一部分,因为它是一个聪明的小东西,可以根据我们的需要生长。我们还需要一个肾脏,但一个就够了还有一个肠子,但我们只需要一米半的小肠,如果我们真的不想要,就不需要大肠子了。我们还需要一些皮肤来阻挡有害的细菌和水分,这样我们就不会太脱水。 Everything else like our limbs, our eyes, our ears, nose, teeth, hair, appendix, reproductive organs, pancreas, spleen, oesophagus, belly buttons, these really are just a luxury. It's definitely very nice to have them all, but we are able to stay alive without them.

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