绘制传染病图

我们发现医学地图是如何在社交媒体的帮助下帮助追踪最近的传染病爆发的……
5月09日

采访

英属哥伦比亚大学Tom Koch博士;大卫·皮戈特,牛津大学

今天,城市之间的快速交通联系意味着新出现的传染病可以在全球范围内迅速传播。因此,科学家们需要一种追踪疾病进程的方法,皮特·斯基德莫尔(Pete Skidmore)一直在研究医学制图如何为疾病传播的动态提供洞见。

皮特:在地图上标出疾病的传播是一种重要的工具2005年底以来的政治和物质世界地图。政府和卫生组织试图遏制流行病的浪潮,因为这使他们能够规划更多的资源,如疫苗和卫生设施。为了了解更多,我采访了加拿大英属哥伦比亚大学的医学地理学家汤姆·科赫博士。

医学制图作为公共疾病研究的一贯工具始于1796年对黄热病的研究。这是我们收集事件的方式,然后我们把它们植入一个特定的地理位置,在那里我们可以找到事件和环境之间的关系,这些环境可以促进或抑制事件的发生。

皮特:想想现在的现代世界,很明显,城市之间的流动性要大得多。有很多数据表明,没有一个城市与另一个城市之间的距离是24小时的。在我们这个流动性越来越大的社会里,我们有没有办法适应应对不同的流行病学因素?

全球化实际上只是重商主义和工业主义的加速版,而工业主义早就存在了。但实际上是十字军东征,城市之间的旅行,在14世纪给我们带来了瘟疫。是全球化和贸易,是人们从一个国家到另一个国家的流动,在19世纪给我们带来了霍乱。所以,首先要认识到的是,这并不是什么新鲜事。它可能加快了一些,但这是程度上的不同,而不是种类上的不同。旅行的速度意味着,尽管我们在技术上取得了所有的进步,但要阻止我们的微生物朋友的进化或它们最终遇到的疾病的发展,将变得更加困难。

现在,传染病在世界范围内的传播速度可能比历史上任何时候都要快,但可以肯定的是,随着全球通信和社交媒体的进步,追踪流行病变得很容易。我和David Pigott谈过,他是牛津大学的博士生,研究我们构建疾病地图的不同方式。

Twitter logo(2010年9月之前)David:我们相信HealthMap、BioCaster、GenBank和潜在的社交媒体等系统可以提供帮助。HealthMap和BioCaster是使用数据挖掘算法在网络上搜索非传统数据源的网站。所以,他们会查看新闻文章,其他网站,如果你使用标准的学术文献搜索引擎,这些网站通常不会出现。加起来,他们每天发布大约400个与不同疾病有关的新帖子。最后,推特和社交媒体目前代表了一种不确定但非常有希望的途径,例如,如果与疾病有关,我们可以使用推特。这将是最困难的任务,试图确定哪些关键词对哪种疾病至关重要,并试图利用其中的信息。但在疾病报告方面,推特是一个非常嘈杂的系统。此前,人们已经发现,Twitter上流感和登革热的趋势可以提前2到3周预测美国疾控中心等传统系统的病例报告趋势。所以,它有帮助的潜力,但我们需要做很多工作来确定这些数据点的准确性。

皮特:你提到了BioCaster和HealthMap。这些措施对最近的H7N9和类似sars的冠状病毒疫情有帮助吗?

Tom - HealthMap和BioCaster一直被用于地图,特别是在中国的新闻报道中,但是,考虑到病例报告和国家卫生服务报告水平之间存在滞后时间,我们希望HealthMap和BioCaster可以尝试减少这种延迟,特别是当涉及到一种非常新的感染时,收集信息的速度是最重要的方面。

Pete -那么,下一次大流行会从哪里来?汤姆·科赫给出了答案。

Tom -我们知道下一次大流行几乎是肯定的,我想说,在10年内,它会像流行病一样,在人口密集的地区开始,那里有巨大的社会和经济不平等,这样就会有一群密集的人生活在贫穷的环境中,通常是和他们的动物一起,然后它会从那里蔓延到一个主要城市,再从那里蔓延到其他主要城市。所以,它可能是从中国或越南开始的,这些地方人口密度大,收入差距大,然后它会在病毒或细菌滋生的当地地区通过旅行者传播,然后它会抓住一架飞机起飞。

Pete -那地图准备好了吗?

汤姆:当然!随着数据的输入,我们可以绘制它,我们可以非常快速地预测,根据特定微生物的性质,它向主要和次要来源扩散的速度。我们知道怎么做。更重要的是,我们能否,为什么不能,确定疾病可能发生的地方,并将我们的国际精力投入到限制病毒和细菌增殖、变异和传播机会的发展中。

所以,新的疾病不断出现,但希望绘制它们的新方法能让我们阻止它们的发展。

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