吉姆·卢普斯基教授——基因组测序

吉姆·卢普斯基教授谈到了基因组测序如何帮助患有罕见疾病的人,包括影响他的疾病。
5月12日

采访

Jim Lupski博士,德克萨斯州贝勒医学院

Kat -现在是时候听听遗传学学会春季会议的更多消息了。首先,这是来自德克萨斯州休斯顿贝勒医学院的吉姆·卢普斯基教授,他是诺贝尔奖得主詹姆斯·沃森基因组测序团队的一员。他解释了包括全基因组测序在内的新技术如何揭示罕见的遗传疾病,包括影响他的一种疾病——沙可玛丽牙病。

Jim -我刚才说过的一个例子是Beery双胞胎,他们的家人对他们的名字被使用没有任何问题,但是他们的家人多年来一直在努力解决孩子们的各种问题。最后,这位母亲读了很多文献她说服神经科医生给他们服用一点左旋多巴当出现异常时,你可以用它来绕过多巴胺能系统。当他们服用左旋多巴后,他们在一夜之间得到了显著的改善。

但多年以后,问题依然存在,尽管不像以前那么严重了。所以,有一个问题是给了太多的药,还是太少的药,到底发生了什么,我们去测序基因组,让我们惊讶的是,他们有一种非常罕见的这种疾病,事实上,他们在一种维生素辅助因子中发生了突变,这种酶需要这种维生素辅助因子才能起作用。但另一种神经递质途径中的其他酶也需要它。

所以,当我们给他们一些绕过其他血清素能途径的化合物时,他们真的得到了极大的改善,这对这个家庭真的有很大的帮助。所以,我想说这很有趣因为这个双胞胎女孩在基因组测序和治疗之前不能参加体育运动,现在已经成为了一名冠军跑步者,而且,蹦床很好,她在蹦床上摔断了胳膊。所以,在我们治疗她的时候,她摔断了胳膊。这是医生引起的问题吗?我不知道。

Kat:这很好,找到了两条路径,而不是一条路径。你认为这在一些复杂的疾病中会很常见吗?

Jim -这是一个很好的问题正如我试图指出的当我们把这个应用到临床时,我们非常惊讶地发现几乎每20个人中就有1个人有两种不同的基因突变似乎在他们对这些临床状况的易感性中起着作用。这使得医生根据他们的临床观察做出诊断看起来非常复杂和困难,因为实际上,这是两种不同事物的混合。所以,我认为这是另一个我们在将其引入临床之前无法预料到的地方,但它会稍微改变我们的想法。

凯特:你也有自己的基因组测序经历。你能告诉我一点吗?

吉姆:这是一个非常有趣的经历,因为我研究过这种疾病,沙克-玛丽-图斯神经病变,虽然我们已经找到了这种疾病的病因和新的突变机制,但25年后,我仍然不知道我的疾病是由什么引起的。所以,我们试着看看基因组测序是否能找到它,毫无疑问,我们确实找到了。但是你知道,给你自己的基因组排序以及潜在的后果是什么,这是以前从未做过的。

凯特-因为你可以在里面找到各种各样的东西。

吉姆:是的,我们确实是这样做的,那当然是每个人开始谈论偶然发现的时候。我们在文献中发现了一个变化,一个9岁的孩子处于持续植物人状态,但我没有持续植物人状态,好吧。事实上,当我们进一步调查时,数据库是错误的。还有其他偶然的发现,分析也误解了那是什么。我们没有发现任何其他癌症易感性或其他偶然发现,必须在医学上可行。所以,是的,一开始有点害怕,因为我们不知道我们会发现什么。但是害怕并不能阻止你前进。关于向前看,我们知道该把研究重点放在我自己的疾病上。因此,我们现在在动物模型中进行了突变,并开始在那里进行研究。

Kat:那么,我猜你是否有可能从对你个人疾病的基因研究开始,在实验室里找到治疗你自己疾病的方法,然后希望也能找到治疗其他人疾病的方法?

吉姆-有可能,好吧。同时,对于分子诊断还有很多要说的,这是我们第一次真正地,真正地说这是一个隐性基因和隐性突变。我们在基因组中有它。我们看着它在父母、祖父母和孩子之间进行。所以,我认为了解诊断本身对家庭非常有帮助。即使家人说,“我知道我有这种病”或者“我知道我没有”但实际上,从临床医生的角度来看,这也是有用的。

Kat:展望未来,你认为基因测序在10年甚至5年内会发展到什么程度?

吉姆-对我来说,这几乎是一种超现实的经历,给吉姆·沃森的基因组排序,然后看着变异,坐在一个房间里,试图向他解释其中的一些可能意味着什么。当然,我们不知道我们在做什么,也不知道这个人在这个国家参与了帮助阐明DNA结构的工作。在他的一生中,他从未想过有人会和他谈论他自己的基因组以及变异可能是什么。那是5年前的事了,而现在,我们已经听到英国宣布了10万个基因组。随着互联网、电脑、手机等颠覆性技术的出现,我们很难知道未来会发生什么,也很难知道它会以多快的速度发生。我确实认为,这些信息可能会让病人在自己的医疗保健中获得更多的权力。这就是我所希望的。

凯特-刚才是贝勒医学院的吉姆·卢普斯基教授。

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