结果:布鲁斯的基因组

布鲁斯的DNA有什么秘密?
2019年9月13日

采访

朱利安·格林和厄休拉·阿恩特,Illumina

Bruce_sequencing_Illumina

小狗布鲁斯在Illumina外面用棉签擦拭他的嘴。

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机器一直在嗡嗡作响,电脑一直在计算黑色拉布拉多小狗布鲁斯的基因序列。现在他的结果出来了。我们的记者阿米莉亚·史密斯采访了Illumina的科学家朱利安·格林和厄休拉·阿恩特。布鲁斯的DNA有什么秘密?

朱利安-布鲁斯的基因组就像一本巨大的书,在某种程度上就像哈利波特系列的几本拷贝。但我们从测序器中得到的是非常短的文本片段,比如单个单词或句子的片段。现在,为了分析这一点,我们要做的就是把这些文本放在一起。

阿米莉亚:所以你基本上是把书重新整理好了,所有的句子和章节都在正确的地方?

朱利安:没错。这就是我们所做的。我们这样做的方法是,我们有一个普通狗基因组的模板,有了这个模板,我们可以把这些单独的片段,这些单独的片段,把它们放在一起。然后我们可以在基因组中寻找所谓的变异或改变,这将告诉我们布鲁斯的基因组与普通狗的基因组有何不同。

艾米莉亚-这到底给你什么启示?你发现了什么?

厄休拉:我们发现你的小狗看起来像拉布拉多犬,从基因上看也很像拉布拉多犬。

阿米莉亚-那么布鲁斯是狼的后代的可能性有多大?

朱利安:他更像狼,而不是猫或人。这就是我们在数据中看到的。通过观察不同品种的狗,我们可以看到,例如,哈士奇仍然与狼非常相似;然后是拉布拉多犬,它们在中间;与狼截然不同的是狗的品种,比如哈巴狗、吉娃娃或梗犬。

艾米莉亚-你在布鲁斯的唾液里还发现了什么?

乌苏拉-这是个好问题。所以我们对此很感兴趣。大部分DNA都是狗的但也有一点细菌。大多数细菌都是正常的,我们可能发现了一点植物,这说得通,因为他在我们取样的时候一直在嚼东西,对吧。我们没有发现我们预期的那么多细菌。布鲁斯只有12周大,所以我认为他的微生物群可能还在发育,直到他成年,就像人类的孩子一样。

Julian -我认为如果你现在看一下Bruce的数据集和对他基因组的理解它可能是我们目前拥有的最好的测序狗。所以在他的基因组中可能会发现更多有趣的东西。我们要做的下一件事就是找到可爱基因,弄清楚为什么他看起来这么可爱。

阿米莉亚-非常感谢你对布鲁斯的DNA所做的研究。

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