场景:布鲁斯!

他才15周大,什么东西都爱啃,而且他身上充满了基因……
2019年9月13日

采访

厄休拉·阿恩特,Illumina

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黑色的拉布拉多犬布鲁斯

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狗的种类繁多。它们可以像大丹犬一样大,也可以像吉娃娃一样小。它们的皮毛可以是棕色,白色,甚至深蓝色,它们可以是短毛到蓬松球的任何地方。它们的细胞内部发生了什么,使它们的形状和大小变化如此之大?我们去基因测序公司Illumina寻找答案。在Will It Sequence的第一版中,我们试图解码黑色拉布拉多犬布鲁斯的基因组。

厄休拉-你好,我是厄休拉·阿恩特,我是Illumina的科学家。你叫什么名字?

艾米莉亚-我是艾米莉亚,布鲁斯是我的,我们这只小狗。

厄休拉-太好了,布鲁斯,显然是一只非常可爱的黑色拉布拉多小狗。我们要从它嘴里提取DNA。我们有个棉签。所以我们要看看能不能让他把它含在嘴里我们要在他的脸颊上摩擦几分钟。

阿米莉亚-你用棉签从口腔里检测到了什么?

厄休拉:大部分是唾液,但我们也应该得到很多狗的细胞。实际上,我们希望的是,我们不只是得到了狗,但我们可能也得到了一些可能在他嘴里的细菌。

阿米莉亚-那你打算怎么处理?

厄休拉-用我们的测序仪对它们进行测序,然后我们可以告诉你更多关于布鲁斯的事情。

艾米莉亚-布鲁斯!

乌苏拉-布鲁斯!糯糯糯,所以现在我正试着擦拭他的脸颊内侧,而不仅仅是他的牙齿,不让他吃掉整根管子。现在他还想咬我的手呢。好了,我想我们没事了,布鲁斯。所以我现在把棉签转过来,所以看起来像棉签的那部分现在在液体里,它会从棉签中提取DNA,希望能保存它。

阿米莉亚-接下来会发生什么?

厄休拉-所以明天早上我们要用这个含有他细胞的液体。我们要分解细胞,我们要保留DNA,扔掉所有的蛋白质或细胞部分,细胞壁,所有不是DNA的东西。我们将对他的基因组进行测序,然后我们将,实际上,我们的生物静力学家将研究狗身上有多少狼的成分,我认为这是我们的主要问题之一。那我们看看还能找到什么。

阿米莉亚-狗的DNA密码有多大?

厄休拉:我认为它基本上和人类一样大。

阿米莉亚-对他的DNA进行测序需要多长时间?

厄休拉:我们计划进行DNA提取,然后建立文库——我们称之为文库准备,这使DNA准备好进行测序——我们只需要不到一天的时间,然后测序将需要一天半的时间。好了,我们现在要采集一些头发样本。我知道你真的…好的。好了,我试着让狗不要扭动,因为我不想在它移动的时候割伤它。但我要从他脖子后面取点头发。你能帮我照看一下你的狗吗?是啊,这里应该有很多头发。这管子里的狗应该够多了。非常感谢你,布鲁斯!

艾米莉亚-布鲁斯?布鲁斯?饼干吗?

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