艾滋病病毒从何而来?

艾滋病病毒最初是什么时候出现的?它是如何成为一种流行病的?
2023年6月20日

采访

保罗·夏普,爱丁堡大学

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黑猩猩

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本周,我们将纪念一种导致大约4000万人死亡的病毒——艾滋病病毒被发现40周年。威尔·廷格尔一直在回顾时间线…

威尔——1981年6月5日——美国疾病控制与预防中心发表了一篇论文,报告了一种罕见的肺部感染,发生在洛杉矶五名年轻的、以前健康的男同性恋者身上。由于某种原因,他们的免疫系统也不再正常工作。五个人都会死。同一天,一位皮肤科医生打电话给美国疾病控制与预防中心,报告在纽约和加利福尼亚的男同性恋者中出现了一种罕见且异常侵袭性癌症的群集病例。

安东尼·福奇:我们称之为“同性恋相关免疫缺陷”或“同性恋癌症”。因为卡波西氏肉瘤。

这种神秘的疾病在同性恋群体中蔓延。这种疾病破坏人的免疫系统,因此被称为“获得性免疫缺陷综合征”或艾滋病,但其根本原因尚不清楚。

电视采访-我注意到我皮肤上的这些肿块,它们看起来有点可疑。它们不疼,但它们很奇怪,而且它们在繁殖。

到1982年底,美国确诊的死亡人数已超过1000人,而且还在迅速蔓延。

电视访谈-嗯,我认为它绝对是可以传播的,只是如何传播,我不知道。是通过血液吗?是通过唾液吗?是通过……我不知道。

今天的新闻报道-巴黎。关于一种致命疾病的惊人数据。90%的感染者都没有意识到自己感染了病毒。

威尔——1983年5月20日。终于有了突破。巴斯德研究所的franoise barr - sinoussi博士和她的同事报告了一种可能导致艾滋病的逆转录病毒的发现。这种逆转录病毒就是HIV。她的理论后来被证明是正确的,她将因此获得2008年的诺贝尔奖。所以我们在过去的40年里就有了HIV这个名字,但是这种病毒本身存在的时间要长得多。

克里斯-确实,那么这种病毒是从哪里起源的呢?以及如何?爱丁堡大学的遗传学家保罗·夏普(Paul Sharp)的大部分职业生涯都在研究这个侦探故事。这些线索表明,由黑猩猩携带的一种名为SIV的相关病毒,很可能在刚果民主共和国首都金沙萨的周边地区,传染给了人类。但这是什么时候发生的,我们又是怎么知道的?

保罗-这可能至少是一百年前的事了。我们认为一种病毒最初是在人类身上出现的。由此,当它在人群中传播时,它在基因组中积累了突变这些变化以相当稳定的速度发生。因此,鉴于我们现在了解这些变化发生的速度有多快,我们可以看看两个菌株之间的差异,并询问它们的共同祖先何时存在。所以我们估计它们大约在一百年前开始分化。

克里斯:从地理上讲,这一切都发生在哪里?

保罗:嗯,我们今天可以看到,这些病毒株的多样性最大的地区是在金沙萨附近。这表明这是病毒真正开始分化成这些不同形式的地方。但我们也可以追踪病毒可能首先进入人类的地方,因为我们已经研究了其他灵长类动物的样本,这些样本中有一种与hiv病毒密切相关的病毒。

克里斯:啊,所以你的论点是,其他一些动物,可能是灵长类动物,有一种与艾滋病毒非常相似的病毒,这种病毒进入人类并成为艾滋病毒,有点类似于一种蝙蝠病毒,一种冠状病毒可以跳过物种屏障,在我们体内引起COVID-19。

保罗-没错。所以当hiv病毒第一次被发现和描述时,唯一已知的与人类病毒密切相关的病毒是在羊身上发现的一种病毒。但很快,人们开始在非人类灵长类动物身上发现更密切相关的病毒,在非洲的猴子和猿身上。所以大约在1990年,我们知道了几种不同的猴子物种,它们有这些病毒,这些病毒在非人类灵长类动物中被称为SIV,即猿类免疫缺陷病毒。在非人类灵长类动物身上发现的与人类病毒关系最密切的病毒是在黑猩猩身上发现的病毒。

克里斯-那它是怎么从黑猩猩传染给我们的?

保罗:我们不知道,因为这可能是一百多年前发生的事情。所以我们只能推测可能发生了什么。我们知道艾滋病毒可以通过血液在人与人之间传播,我们也知道在西非和中非的人类猎杀黑猩猩,我们认为这发生在那里。所以当你猎杀一只黑猩猩的时候,你很可能会立即对你已经杀死的黑猩猩进行屠杀,以便更容易地把它带走。这样一来,血液中就会含有黑猩猩病毒,这种病毒很容易传播到猎人的开放性伤口上。所以我们认为这种病毒很可能是通过屠杀黑猩猩传染给人类的。

克里斯-据推测,这些病毒已经在灵长类物种中存在了几百到几千年,人们也已经猎杀它们几百到几千年了。那么,为什么会发生这种情况呢?

保罗-我们认为改变的是人类。从某种意义上说,在中非西部的这一部分,我们认为从黑猩猩到人类的传播最早发生在那里,直到大约100年前,那里还没有真正的大型定居点。西非和中非没有这样的城市。直到一百多年前,人们才开始聚集在大城市里举行大型集会。我们怀疑这种病毒最初是在农村地区传播给个人的,它需要传播到大城市,传播到大量人群中,才能真正从一开始的流行病中传播开来,成为大流行。

Chris -我能请你谈谈你认为这一切具体发生在哪里吗?

保罗:黑猩猩,普通的黑猩猩,实际上被分为四个不同的亚种,其中只有两个亚种感染了艾滋病毒的祖先。黑猩猩病毒来自一个特定的地区,在喀麦隆的东南角。这些是特别接近HIV 1的病毒。它向我们表明,这是世界上第一次发生人类进化的地方。那是一个非常偏僻的农村地区。我提到过,病毒可能要传播到更大的城市才能真正开始传播。所以当我们看地图时,我们可以看到喀麦隆黑猩猩病毒所在的地区,被河流包围,这些河流都向南流入刚果,然后流入金沙萨。因此,病毒又通过一系列受感染的个体传播到了金沙萨。它开始在人群中传播,然后从那里扩散开来。然后我们看到的是,在病毒的基因组成中,我们可以看到不同的病毒株已经传播到非洲的不同地区。 And then having spread across Africa, they then spread out across the world. One of my colleagues has shown that the most likely route out of Africa initially was through the Caribbean, through Haiti and then from Haiti into the United States, from the United States over to Europe.

克里斯-这是一段很长的旅程,不是吗?所以这里有一个巨大的冰山。在我们意识到它在所有这些不同的人群中,在所有这些不同的地理位置上建立起来之前,它可能已经漂流了一个世纪,将近一个世纪。

经常有人问我,像艾滋病毒这样致命的病毒,怎么可能在人类中存在了50多年而我们却不知道呢?我认为答案很简单。如果你看一下,一个病毒的指数传播,从一百多年前的一个或几个人感染到现在的数百万人感染。如果你把感染人数的增长率画出来,你会推测到1960年只有几千人被感染。这些人都在中非,当他们患上艾滋病时,他们会遭受各种各样的疾病的折磨。因为很明显,艾滋病病毒会破坏你的免疫系统,使你容易受到其他感染,其他细菌或真菌感染。因此,这种病毒能在这么长一段时间内不为人知,我一点也不感到惊讶。

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