DNA模拟记忆机制

美国科学家培育出具有DNA记忆的细菌。
11月14日

美国科学家培育出具有DNA记忆的细菌。一种来自大肠杆菌的DNA解旋酶(Ruva蛋白)

以重量换重量,以空间换空间,DNA提供了迄今为止发现的最紧凑、最高效的信息存储系统。它不仅有弹性,化石标本证明了它存活了几万到几十万年,而且它还编码了自己的备份系统,包括两个成对的链,一个是另一个的镜像。数以百万计的人也可以利用大自然已经发明的机器来制造复制品。

为了证明这一点,近年来,科学家们已经能够将文学作品甚至整个计算机程序以DNA格式存储,方法是首先将数据转换成基因字母序列,然后将这些字母连接起来形成DNA链。为了获得原始数据,你使用标准的DNA解码技术读取DNA序列。不像莎士比亚戏剧纲要那样要占据整个架子,DNA可以在一个小小的试管中储存同样数量的DNA。

现在,研究人员又向前迈进了一步,赋予细菌以dna为基础的实时记忆,可以记录细胞事件、经历或暴露。而且,通过将数据存储在细菌种群中,还可以在存储中添加模拟元素,从而记录暴露或事件的水平或强度。

麻省理工学院的研究人员Timoythy Lu和Fahim Farzadfard在《科学》杂志上写道,他们首先在细菌中构建了相当于传感器和编辑工具的基因。传感器的工作原理就像一个开关,当某种化学物质存在时就会激活。这开启了一个编码编辑工具的基因,编辑工具最终由一小段DNA组成,这段DNA被预先编程为识别、改变或编辑细菌DNA中其他地方的单个遗传字母,例如将DNA字母a转换为字母T。这个DNA字母的改变不必对细胞产生不利影响,因为可以选择基因组的区域以避免改变任何活性基因。

一旦这种基因编辑完成,细菌就会保持这种变化,最重要的是,它会把这种变化传给后代。这意味着,最终,培养物中携带改变DNA序列的细菌的比例必须反映出传感器检测到的化学物质的暴露程度。通过这种方式,细胞群除了存储有关暴露或事件的数字信息(“是”或“否”)外,还存储了发生了多少暴露的模拟记录。

也可以同时写入多个遗传记忆,因此可以对细菌进行编程,使其同时监控几种不同的事物,并在基因组的不同区域存储不同的“比特”信息。因此,该系统可以用于生产环境中化学物质的定量生物探测器,甚至,通过将他们的系统与细胞内不同时间激活不同基因的过程相结合,它可以用来更好地了解细胞内随着时间的推移而发生的分子时钟。

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