染色体:进入你的基因

一项新的艺术与科学合作将染色体带入生活。
6月14日

采访

巴伯拉罕研究所的Mikhail Spivakov和Csilla Varnai

凯特·阿尼最近前往剑桥,主持一个名为CHROMOS的有趣活动,该活动由巴布拉罕研究所主办,该研究所坐落在城外的乡村。这是一个不寻常的夜晚——客人们被邀请直接进入人类基因组,使用虚拟现实耳机体验由视觉艺术家安迪·洛马斯(Andy Lomas)利用该研究所科学家实验产生的三维染色体结构的真实数据创造的一个扭动起舞的DNA世界。

此外,著名电子音乐家马克斯·库珀(Max Cooper)受科学和视觉化的启发,创作了一段大气的配乐——也就是你可以在背景中听到的音乐。在活动开始之前,Kat采访了来自剑桥Babraham研究所的Mikhail Spivakov和Csilla Varnai,以了解这次不同寻常的合作是如何实现的。

米哈伊尔-我们的想法是分析DNA的三维结构以及DNA是如何在细胞核中包装的,这对于理解细胞如何利用DNA来完成它们需要做的事情非常重要。但它在视觉上也非常吸引人,我们觉得这将是一个很好的机会,把我们的科学与艺术联系起来,告诉人们更多的东西,也许让他们更多地了解DNA是怎么回事,它是什么。

Kat:那么你是如何开始尝试创造这种艺术的呢?因为它不仅仅是视觉艺术,对吧?音乐也是如此。

Mikhail -这是从我读到的对Max Cooper的采访开始的,他提到他有计算生物学的博士学位。我真的很兴奋,我想,实际上,他一定是做这种事情的理想人选。所以我通过推特联系了他,他非常兴奋。

我们把他请到巴伯拉罕研究所,从那时起,我们决定真正地创造一个项目,不仅仅是关于DNA的音乐,受DNA启发的音乐,还有视频,这就是马克斯让安迪参与进来的时候他已经和安迪合作过很多次了。它变成了一个关于DNA以及DNA如何在细胞核中排列的音乐视频项目。

Kat -虚拟现实组件是怎么进来的,因为它绝对是梦幻般的-我已经尝试过浏览所有这些数据了?

希拉:那完全是安迪的主意。所以我们委托Andy和Max为我们制作一个音乐视频,然后在我们的一次会议上,Andy带着一个VR套件出现了,我们都可以沉浸在这个虚拟现实中,从三维的角度看一个分子。

凯特-就像在母体里一样。在空间中有这些扭曲的东西。你可以把自己放在里面,看到所有的线圈在移动。当我们置身于这样的环境中时,我们看到的是什么?

所以我们现在看到的是DNA在细胞核中的三维结构。我们可以看到实际的染色体单独移动,除此之外,我们还可以看到红色的热点,那里有活跃的DNA基因它们形成不同的簇,所有的基因都在那里被解读为为细胞制造蛋白质的配方。

凯特-这是你从实验室得到的真实数据。数据是什么?你从哪儿弄来的?

希拉:我从我的同事在巴伯拉罕研究所做的实验中得到了这些数据。数据的来源是DNA的有效联系信息。因此,我们有一个接触列表关于DNA的哪些部分与DNA的其他部分接触。利用这些信息,我的工作是重建细胞核中染色体的可能形状。

作为一名科学家,当你站在虚拟环境中,看着你的工作在你周围旋转时,你有什么感觉?

希拉:太棒了!我以前在二维空间里见过或者在其他软件里见过你可以拖动和移动分子,但它实际上是进入了一个新的维度。

凯特-西拉·瓦尔奈,以及她之前来自巴伯拉罕研究所的米哈伊尔·斯皮瓦科夫。

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