全球土壤细菌地图集

人们研究了来自世界各地的土壤样本,以发现它们所含的细菌。这项技术揭示的绝大多数微生物甚至没有名字……
2018年1月19日

到处都是土壤样本科学家们已经研究了它们所含的细菌。这项技术揭示的绝大多数微生物甚至没有名字

当我们想到细菌时,我们往往会在脑海中浮现出让我们生病的令人讨厌的病原体的图像。但细菌在很多方面都有着令人难以置信的多样性,包括它们生活的地方以及它们如何与环境相互作用。成千上万种不同的细菌菌株生活在人体内,其中许多对帮助我们正确消化食物至关重要。

在我们脚下的地面上也发现了巨大的细菌群落,其中大多数在土壤中,在植物根部周围生活着成千上万种不同类型的细菌。就像生活在我们体内的细菌一样,有些是有害的病原体,但许多是植物生存所必需的。如果没有这些细菌,很可能就没有植物,没有陆地动物,也没有人类。

然而,尽管它们的重要性和数量巨大,我们对土壤细菌几乎一无所知。但现在,他们的研究成果发表在科学,科罗拉多大学的科学家们通过比较世界各地土壤样本中的细菌数量,采取了一些措施来改变这种状况。

在诺亚·菲勒的带领下,科罗拉多团队从六大洲的237个地点采集了土壤样本。他们使用基因测序技术读取DNA,并在每个样本中识别不同类型的细菌。

菲勒解释说:“尽管土壤细菌种类繁多,但我们发现有一个相对较小的子集——大约500种——占主导地位。”“换句话说,这2%的土壤细菌类型占全球大多数样本中细菌细胞的一半左右。”

有趣的是,该团队发现的大多数主要类型以前从未被测序过。基因测序将它们确定为不同的类型,但研究小组无法确定它们是什么,因为之前没有记录过它们。

“其中大多数,我们一无所知。它们没有名字,我们不知道它们在土壤里做什么,我们也没有在实验室里种植它们。这确实凸显了我们对生活在土壤中的生物知之甚少,”菲勒说。

研究小组希望,在了解了不同类型的土壤细菌生活的地方之后,他们现在可以开始了解环境条件如何影响细菌群落,以及这反过来如何影响植物的生长,包括重要作物。

“下一步是弄清楚这些主要类型在做什么,以及它们如何影响土壤健康。许多可能是有益的,这是未来研究的一个令人兴奋的领域——弄清楚我们如何管理土壤微生物群落以更好地种植作物,”菲勒解释说。

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