生活第36集:癫痫和寿司

在本集节目中,我们将了解癫痫、神经元运输的寿司带模型、古代特洛伊的母亲、亚马逊雨林以及科学报道中的偏见。
2017年2月21日
提出的克里斯•史密斯

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伐木后亚马逊吸收了多少碳?

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在本集节目中,我们将了解癫痫、神经元运输的寿司带模型、古代特洛伊的母亲、亚马逊雨林以及科学报道中的偏见。

在这一集里

癫痫引起环氧化酶介导的血管收缩,导致大脑皮层缺氧

00:33 -氧气和癫痫

脑血流量减少是癫痫大鼠发作后症状的原因

氧气与癫痫
与卡尔加里大学的Cam Teskey合作

大约1%的人患有癫痫症,大脑中的一群神经细胞自发地产生一种异常的放电模式。这种情况会扩散到邻近的大脑区域,也会影响它们的活动,病人经常会失去意识。一旦潜在的异常神经活动稳定下来,这可能需要一两分钟,患者就会开始恢复,但他们通常会在很长一段时间内感到困惑和困倦,这可能会对个人的生活质量产生深远的影响。卡尔加里大学的卡姆·特斯基向克里斯·史密斯解释了他是如何通过对老鼠的仔细观察,找出了这种情况发生的原因,并强调了一种阻止这种情况发生的潜在方法……

患有癫痫的人,在癫痫发作后,大约80%的人会经历我们所说的癫痫发作后的行为障碍。可能是感觉障碍,可能是认知障碍,也可能是运动障碍。事实上,一个叫罗伯特·本特利·托德的人在150多年前就描述过这种运动障碍。但我们一直不了解大脑的机制。我们推断这些后脑功能障碍很像短暂性脑缺血发作,像中风。我们所做的就是我们拿了一个非常精细的氧气记录设备我们把它放进老鼠的大脑我们引发癫痫,我们只是想看看氧气水平是否改变。

克里斯-他们会吗?

卡姆-他们戏剧性地做到了。有趣的是,在癫痫发作期间,氧含量会有所下降,然后又会恢复到基线水平。但大约一两分钟后,氧气水平急剧下降,下降到我们所说的严重缺氧阈值以下,这将持续一个小时,最终回到基线。我们注意到的是在这些老鼠的缺氧期和行为功能障碍之间有关系。如果癫痫发生在运动皮层,他们就无法形成新的记忆,也无法表现出肌肉力量。

Chris -你认为或者你知道氧张力的下降是因为供应有问题还是因为癫痫发作时大脑的那块区域过度劳累,有一个有效的氧债所以细胞只是把氧气拉进来就像没有明天一样这就是局部记录的低氧水平的原因?

小卡-是的。我们学到了两件事。我们了解到血管本身为癫痫发作的局部区域提供血液,它们收缩,收缩到只有不到50%的正常血液供应给这些区域。这是血液供应减少导致的低氧水平。但这不是癫痫本身,我的意思是我们发现了两种导致血管收缩的机制。其中一种是环氧化酶2简称COX-2。发生的是COX-2在癫痫发作时变得非常活跃我们所做的是使用一种药物来阻断这种酶。所以当癫痫发作时,你没有血管收缩,也没有低氧水平,那么动物就不会表现出行为紊乱。所以这不仅仅是癫痫发作。癫痫发作会引发一系列由COX-2介导的事件导致血管收缩,血流量减少,然后缺氧。 And it’s that that is responsible for these behavioural impairments.

克里斯-阿司匹林是抑制环加氧酶的好方法。那么,服用阿司匹林的癫痫患者是否有较低的后发嗜睡率呢?

卡姆:这是个很好的问题,克里斯,我们一直在查阅文献和数据库来回答这个问题。我现在不能给你明确的答复。我们已经发现了其他更有效的药物。事实上,我们在动物模型中发现的最有效的药物是布洛芬,布洛芬对COX-2酶起作用。这是我们现在在实验室里正在做的工作。

克里斯:你有没有在人类病人身上进行研究,看看在这些实验动物身上表现出来的东西是否也存在于真正的特发性人类癫痫患者身上?

小卡-是的。我有个好朋友兼同事叫保罗·费德里科。他是卡尔加里大学的神经学家。我们有一种叫做视频脑电图实验室的东西癫痫病患者来了,他们戒掉了抗惊厥药或抗癫痫药。他们经常会自发发作。现在,他们来这个病房的原因是为了确定他们大脑的哪些区域与癫痫发作有关,为可能的脑部手术做准备。但是保罗,用动脉自旋标记功能磁共振成像,在10个病人癫痫发作一小时后观察其中8个病人癫痫发作的大脑区域血流量明显减少,和我们在老鼠身上看到的情况类似。

一个内部的输送系统在神经元内部移动分子。

06:15 -测试寿司带模型

模拟揭示了蛋白质和其他分子在神经元周围运动的速度和精度之间的权衡

测试寿司带模型
与剑桥大学的Timothy O'Leary合作

一个多世纪以来,从身体的一端到另一端传递信息的神经或神经元一直吸引着解剖学家。一个突出的问题是,这些长达几米的细胞是如何为细胞的所有偏远部分提供能量和原材料的,而这些通常只在细胞的一个中心区域产生。一种流行的观点是,神经元包含一个微观的传送带系统,它将物质运送到细胞内需要到达的地方。但是,通过建立一个数学模型来解释这是如何发生的,一位科学家发现,任何等待像这样的系统提供晚餐的人最终都会非常饥饿,所以一定有别的事情在发生,正如他向克里斯·史密斯解释的那样……

蒂莫西:我是剑桥大学的蒂莫西·奥利里博士,我是信息工程和神经科学的讲师。今天,我们在剑桥的一家寿司店,这是一家拥有时髦的寿司带机制的寿司店,当顾客坐在寿司带周围时,所有的菜都可以送到顾客手中。

克里斯:这和细胞生物学有什么关系?

蒂莫西:我感兴趣的细胞是神经元,神经元基本上是让你的大脑工作的细胞。一个典型的人有大约860亿个神经元,一个神经元可以潜在地连接数千个其他神经元,正是这种连接赋予了你的大脑力量。那么,神经元是如何相互连接的呢?为了伸出手去和它们的邻居联系,它们有这种又长又细的树枝状突起,叫做树突。所以如果我们在显微镜下观察一个神经元,它看起来就像一棵树,一棵枝繁叶茂的树,有很多树枝,有些还很长。如果我们放大这个神经元,观察其中一个分支的内部,我们会看到有很多东西在分支上上下移动。这是因为神经元是由许多蛋白质和小成分组成的,这些成分都需要在细胞内制造和移动。所以有时候物质需要在细胞的一部分制造出来,然后转移到细胞的另一部分。我们使用的类比是寿司带因为细胞内确实有一些东西以类似寿司带的方式移动这些货物。

克里斯:实际上,你可以想象一下,核心是一本食谱,厨师站在那里,烹饪东西,把它放在盘子里,然后放在寿司带上。它们在牢房周围被运送,而牢房中需要它们的部分将在不同的地方从寿司带上取下盘子并使用它们。

蒂莫西:这就是我们目前的情况。

克丽丝:有什么问题吗?

蒂莫西:生活并不是这样的。在分子水平上,这些粒子的运动是随机的,这意味着其中有偶然因素。为了解释这在寿司店的比喻中意味着什么,让我们想象一下,我们正在等待金枪鱼卷,而它离我们只有几英尺远。但是随机地,传送带改变了方向,开始向另一个方向移动,这将是非常令人沮丧的。但更令人沮丧的是,如果我们旁边的人根本不想要金枪鱼卷,只是拿起金枪鱼卷,在桌子上放了一会儿,然后可能决定把它放回腰带上。这些都是在分子水平上偶然发生的事情,正是因为这个原因,我们可以预期,在神经元内部的运输机制中,有时会有很长的延迟。

克里斯:细胞能忍受长时间不吃金枪鱼卷吗?实际上,你是说这是非常重要的限制吗?一定有别的什么原因导致细胞无法忍受这种情况?

蒂莫西:这就是这项研究的动机。我们所做的就是收集实验数据,科学家们测量了这些微观粒子的运动,然后我们简单地进行了测量和数学运算。我们算出了一组粒子穿过一个典型大小的神经元平均需要多长时间。结果有一个数字大得令人失望。在一个典型的神经元中分配货物可能需要数小时或数天的时间。这让我们很惊讶,因为我们中的许多人认为货物可以在最坏的情况下在几分钟或几小时内分发出去。

克里斯:细胞会不会做一些其他的事情呢?细胞会不会说,“嗯,我可以容忍寿司带的一些限制,但同时,我也会有自己的本地解决方案,我会在本地制作一些东西,这样我就不会受到阻碍了。”所以如果现在寿司带上没有,我就自己做。”

蒂莫西:这是绝对正确的,事实上,近年来,人们观察到神经元确实有能力在局部制造它们需要的东西。然而,他们在当地生产的东西的原料和制造它们的机器仍然需要运送到这些地方。我们的观点是,这可能比目前认为的要长得多。

克里斯:我想你所做的是,a.)强调其中的一些不一致,但你现在也用这个模型产生了一堆可测试的假设。

蒂莫西:没错。所以,现在窥视一个活的神经元内部并观察这些组成部分的运动已经成为可能。人们现在可以做的各种实验可以开始解决模型的一些预测。我们可能会发现,实际上,神经元比我们想象的要聪明得多,它们能够比我们的计算表明的更有效地分配成分。这就是为什么我们的模型做了尽可能少的假设。现在,如果进一步的观察与这些预测相矛盾,那么我们知道,实际上,我们对这个分子寿司带的理解还有一些缺失。

有妊娠感染证据的骸骨,来自特洛伊。

12:20 -特洛伊的教训

考古证据表明,古代特洛伊的一名年轻女子死于与怀孕有关的感染

特洛伊的教训
与威斯康辛大学麦迪逊分校的凯特琳·佩佩尔合作

在世界某些地区,与分娩有关的死亡率可高达50%。但这并不是一个新问题,正如克里斯·史密斯从威斯康星大学麦迪逊分校的凯特琳·佩佩尔那里听到的那样……

凯特琳:故事开始于亨利克·基塞维特,他是一位考古学家和医生,正在检查一座可以追溯到800年前的特洛伊古城的墓地。在检查一名年轻女子的骨骼时,她在她的肋骨底部发现了两个结节。这些结节和草莓差不多大,看起来就像白垩白色的物质。Kiesewetter博士认为它们是肺结核造成的钙化肺块。

克里斯:这与肺结核患者的肺组织经常出现钙化这一观点相吻合,不是吗?它们的解剖位置应该是对的,尽管结核喜欢在肺的顶部而不是底部,不是吗?

凯特琳:对,没错。当然,在这中间的800年里,事情很容易就会发生变化。于是,她把结核给了威斯康星大学麦迪逊分校的考古学家William Aylward, Aylward博士联系了我,因为我在结核病的进化方面做了很多工作。

克里斯:考古学家递给你两块草莓大小的白垩质物质。你是怎么做的?

凯特琳:我不是古代DNA专家。所以,我做的第一件事就是寻求一位古代DNA专家的帮助,这样我们就可以从结节中恢复DNA并做出诊断。在这种情况下,我们获得了大量的古代细菌和人类DNA。

克里斯:那么,这些细菌的DNA可能存在于环境中吗?所以,当这个人死后被埋葬,他们可能在那个时候在尸体上定居或者你认为这些细菌与那个人活着时发生的那些损伤有密切的联系吗?

凯特琳:我们认为这是年轻女性生前留下的伤口。原因是我们也检查了土壤,但没有发现这些细菌。它们也是众所周知的会导致人类疾病的细菌。

克里斯:是什么?

凯特琳:所以有两种,腐生葡萄球菌和阴道加德纳菌,都很拗口。腐生葡萄球菌是尿路感染的常见原因,阴道加德纳菌是正常微生物组或细菌的一部分,通常在体内发现,也会导致一系列疾病,包括妊娠并发症。

克里斯:你认为这就是原因吗?你认为这些结节是某种妊娠并发症吗?

凯特琳:是的。我认为她感染了一种叫做绒毛膜羊膜炎的疾病这是一种围绕发育中的胎儿和胎盘的感染,它会导致胎儿患病,导致妊娠流产,也会导致母亲患病。根据她的遗体估计她死亡时的年龄,据认为她死亡时的年龄在25至35岁之间。

克里斯:那她为什么会死呢?

凯特琳:我们还不确定,但我认为,从从结节中发现的细菌数量来看,她的感染非常严重,我认为这种感染很可能导致了她的死亡。

克里斯:这篇论文除了非常有趣之外还有什么重要的?你发现了800年前的病理学?这意味着什么?它教给我们什么?

凯特琳:这是第一次从考古记录中详细研究与怀孕有关的感染。我们知道妊娠并发症在现代社会非常重要在历史上也是如此。所以,就了解古代世界的产妇保健而言,我认为这是非常重要的。就细菌而言,我认为我们了解了这两种细菌是如何进化的,它们是如何随着时间变化而变化的。这有助于我们了解致病细菌是如何进化的。

伐木后亚马逊吸收了多少碳?

17:31 -破坏碳平衡

选择性砍伐后,气候影响了亚马逊雨林储存碳的能力。

扰乱碳平衡
UMR Écologie des Forêts de Guyane的Camille Piponiot

亚马逊雨林在南美洲占地面积超过550万平方公里。有些人称它为“地球之肺”,因为森林每年吸收超过20亿吨的二氧化碳。但该地区正受到伐木的威胁,包括“选择性伐木”的做法,尽管这对森林和碳预算的影响尚不清楚。克里斯·史密斯从一位研究人员那里得知……

卡米尔:我是卡米尔·皮波尼奥,在法属圭亚那大学工作。我们在这里看到的是“选择性砍伐”,这在亚马逊地区是一种普遍的做法。它包括有选择地采伐几棵树,让森林的其余部分在采伐后再生。我们知道它对森林有很大的影响,你砍伐的树木和你砍伐的树木会向大气中排放碳,这意味着温室气体。但我们也知道,剩下的森林重新生长的部分会储存碳,这就是我们感兴趣的——它是如何储存碳的。

克里斯:这是一个相当复杂的问题,不是吗?那么你是如何研究这个问题的,并计算出这个过程对整个亚马逊地区的影响,因为亚马逊是一个很大的地方,所以整个亚马逊地区都是一样的吗?

卡米尔:是的。所以,我们所拥有的是来自卫星的数据,这些数据可以告诉你森林是如何生长的,或者你可以得到地面上测量的数据,比如树木生长的测量数据。每棵树都被测量过,这就是我们所拥有的。我们在亚马逊各地都有一些被砍伐过的地块,然后对它们进行了几年甚至30年的测量。通过使用这些数据,我们获得了大量关于伐木后森林中发生的所有过程的数据。

克里斯:所以你可以通过观察伐木的规模、某些树木的砍伐以及大树被砍伐时造成的损害来计算出碳排放量。然后你可以看一下长回来的东西因此,你认为它在长回来的过程中吸收了多少碳你可以做一下碳方程。

卡米尔:没错。你可以很容易地测量出第一年排放了多少碳。要获得记录后所有进程的数据要困难得多,因为它会持续几十年。

克里斯:那么,这种情况发生的规模有多大?告诉我们亚马逊有多少土地正以这种方式被开发?

卡米尔:在亚马逊地区,每年至少有200万公顷的土地被开采,这意味着每年整个地区的1%被开采。

克里斯:天哪!那很多,不是吗,1%?当你开始计算碳的总和时,这些数字是什么样子的?方程是什么样的?

卡米尔:我们研究了气候和土壤特性的影响,发现不同地区之间存在很大差异,降雨量少、降雨季节性强的地区在伐木后碳储量更少。因此,森林在砍伐后生长得更少,储存的碳也比亚马逊北部少,那里降雨更多,季节性降雨更少。在那里,我们看到储存了更多的碳,尤其是伐木后留下的大树。

克里斯:你的意思是,虽然你发现了这种关系,但亚马孙地区并不是每个地方都平等,有些地区比其他地区更容易受到某些类型的伐木或农业活动的影响。所以,这不仅仅是一个简单的例子,我们有一个放之四海而皆准的政策来可持续地砍伐亚马逊雨林。

卡米尔:对,没错。我们发现,在任何地方,大树都能储存更多的碳。所以,我想,避免对大树造成损害的伐木做法将有助于伐木后的碳回收,但并不是所有地区都是一样的,亚马逊南部更容易受到伐木或其他做法的影响,伐木后生长得更慢。

克里斯:那么,你想要传达的信息是什么?这将如何改变我们对亚马逊管理的看法?

卡米尔:亚马逊是一个非常多样化的地区,当我们考虑规划伐木时,我们必须非常小心,因为这可能会对一些森林造成更大的影响。此外,如果我们想改进碳模型,考虑气候或其他环境变量是非常重要的,因为你可以大大提高模型的准确性。

一个检验发表偏倚影响的模型。

22:40 -歪曲事实

对发表积极成果的偏爱使得科学上的真假主张更难区分。

歪曲事实
北卡罗莱纳州立大学的凯文·格罗斯

现在,如果你考虑一下我们这个月的节目,你可能会发现我们没有强调任何负面结果。我们并不孤单。每周发表的大量研究都集中在积极的发现上。但是,凯文·格罗斯告诉克里斯·史密斯,这在科学上相当于搬起石头砸自己的脚。

凯文:那么,我们所做的就是看看科学中某种趋势的后果,科学家们必须传播他们的发现,因为这些渠道优先传播积极的结果。这种趋势的存在有着非常合乎逻辑和可以理解的原因,但是这种趋势,如果走得太远,实际上会开始降低科学作为一个集体企业的能力,从错误的模式中筛选出真实的模式。我们在论文中所做的是研究如何通过科学出版物强调积极结果而不是消极结果的趋势来调节这一点。

克里斯-你是怎么做到的?

凯文:我们使用的工具是数学建模。因此,我们以一种令人尴尬的简单方式对发表过程进行了数学抽象,并研究了科学家作为一个群体如何评估科学观点的证据的动态。一个非常可爱的比喻来自法国哲学家布鲁诺·拉图尔他把这个过程看作是认识论场上的橄榄球比赛两个终点区代表科学作为一个整体,接受或拒绝一个观点。每一项连续发表的研究都把这个球推向了一个或另一个终点区。这或多或少就是我们所做的。

克里斯:当球落到球的一端,对方射门得分的时候,一个事实就在人们的心里扎根了,是吗?

凯文-没错。这代表了科学界作为一个整体认为这个问题已经解决的结果。

Chris -我是在转译你说的话,但问题是,如果我们从新西兰队,南非队,还有我敢说,英格兰队中挑选最好的球员,然后把所有最好的球员都放到骰子的一边,把球推到等式的“事实”一边,不可避免地,有些事情会变成事实,而在现实中,可能没有足够的证据来支持这一点。

凯文-是啊,这是一个很好的说法。出版过程——我们建立的人类机构,用来相互交流我们的成果。因为它对结果有一种可以理解的偏好似乎表明存在一种模式,如果这种偏好足够强烈,它确实会产生一种趋势,让橄榄球朝一个终点区移动,从而使整个过程效率降低。

Chris -所以当你运行你的模型时,真正重要的驱动因素是什么,这告诉我们我们将走向何方——我不想用“错误”这个词,但我们可能有改进的余地,以便在未来将这种偏见降到最低?

凯文-是的。这是个好问题。这就引出了一个问题,有什么补救措施,或者我们如何改进现有的流程。我认为我们的模型显示的一件事是如果我们回到橄榄球的比喻,你可能会想到的一个答案是把球场做得更长一点。我们可以把球门区往后挪,再拖一段时间再考虑问题的解决。我们的模型显示,这可能会延长比赛时间,但最终并没有真正的帮助。你仍然留下了一种低效的过程来区分真实的主张和虚假的主张。真正有帮助的是重视不检测模式的结果的交流。也就是说,要重视负面结果的报道,我认为这既是期刊的编辑实践问题,也是会议记录的问题。但还有一个更大的问题,作为一个科学界,我们长期以来一直有一种重视积极结果而不是消极结果的心态。 Again, for some good reasons. But I do think we might want to rethink that habit a bit.

Chris:有些人建议,一种方法可能是鼓励人们公布他们所有的数据,因为一些偏见是在数据挑选的过程中出现的。你是怎么看的?

Kevin -在一个我们有无限的心智能力去学习所有已经完成的工作的世界里,发布每一个最后的数据当然是有意义的。科学家的认知能力是有限的,所以有一种说法叫做“杂乱的办公室问题”,如果你把所有的数据都公布出来,你可能会在嘈杂的海洋中失去信号。我认为这是一个非常引人注目的问题。我认为在这方面还有很多工作要做,以了解在这个范围内什么是最佳的或好的着陆地点。至于我们是否应该公布所有数据,但我肯定认为我们应该公布比目前更多的负面结果。

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