《星战前夜》:玩家分析COVID数据

一款大型在线视频游戏的玩家一直在为COVID研究进行至关重要的“流式细胞术”……
11月17日

采访

杰西“Nobutadas”;英属哥伦比亚大学的Ryan Brinkman;Páll gr tar Bjarnason (CCP Games);Jérôme waldishhl,麦吉尔大学

游戏

一个人戴着耳机玩电子游戏时从后面看到的头部。

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各种各样的人都参与了对抗COVID的战斗,现在有一个新的团队在城里-电脑游戏玩家!他们正在通过一个项目提供帮助,该项目让一款非常受欢迎的在线太空游戏的玩家在玩游戏时解决谜题,并为试图研究人体对冠状病毒反应的科学家识别免疫细胞。伊娃·希金波坦报道。

Jesse - EVE是一款难以描述的游戏。你可以在游戏中扮演一个太空海盗,四处偷窃或杀死其他太空舱。你可以是一个从事工业的人,在那里你观察市场,或者你开采自己的材料,然后你制造东西给其他玩家使用,其他玩家去炸,甚至你自己。你可以成为一个贸易大亨

伊娃-那是杰西,一个游戏的狂热玩家叫EVE Online,正如你刚才听到的,你可以在太空中生活出一个完整的复杂的生活。但现在,当你心不在焉地挖掘资源或等待穿越虫洞时,有一项新活动让你投入其中:分析冠状病毒研究的数据,这是“发现项目”的一部分。Ryan Brinkman解释道。

Ryan:第一件事,可能也是最重要的一件事是:我们正在努力帮助科学家对抗COVID。其中一项被广泛应用的技术是流式细胞术。我们使用流式细胞术的目的是观察存在于我们血液中的不同细胞,即用于检测感染和对抗感染的白细胞。我们取一个病人的血液样本,然后给细胞贴上标签,这样当它们一个个经过激光时就会发光。我们标记这些细胞的是蛋白质,在细胞表面我们知道这些蛋白质定义了这些细胞的功能。

Eva -这些蛋白质标记物对科学家来说就像路标一样,告诉他们病人血液中存在什么样的细胞。这很重要,因为当你的身体对某种东西产生免疫反应时,会有很多不同类型的白细胞参与其中,了解哪些免疫细胞普遍存在,以及以何种比例存在,可以告诉科学家大量关于患者如何对冠状病毒等感染或治疗做出反应的信息。科学家们现在可以同时在这些细胞表面标记多达50种不同的蛋白质。但是,尽管这项技术很强大,但问题是……

流式细胞术数据分析烂透了。我们有50个维度的数据,科学家们正在努力研究。当科学家受到二维计算机屏幕的限制,试图找到重要的细胞群时,很难遍历这些数据。

Eva -基本上,流式细胞术分析是费时费力的。它包括在一组点周围绘制形状,每个点代表患者血液中的一个细胞;试着判断这个点是那个星团的一部分,还是在它自己的星团里,或者是那个星团里,你就明白了。事实是,目前让电脑为我们做这一切太过复杂和主观。毕竟,人类已经进化得非常非常擅长观察模式。

瑞安:那些不能很好地捕捉图案的人在数百万年前都被剑齿虎吃掉了,对吧?

伊娃:所以瑞安和他的团队所做的就是把50维的数据分解成许多二维的谜题。这就是《星战前夜》的由来。这些2d谜题经过美化后上传到《EVE Online》的世界中,玩家可以将其作为迷你游戏的一部分进行访问,就像寻找敌方飞船的主要业务的附带项目一样。你解决的谜题越多,你在游戏中获得的奖励就越多。显然,我必须在Páll grassatar Bjarnason的监督下尝试一下,他与一家制作《EVE Online》的公司合作……

我给自己开了个账户,塑造了自己的角色,还有一艘宇宙飞船。所以我看到的基本上是…

我可以看到一个有X轴和Y轴的图形。屏幕上有各种不同颜色的点。在图形的某个部分中,有高密度的点,它们都被涂成红色。在密度较低的地方,它们是蓝色或紫色的,就像热图一样。每一个点都是一个单独的细胞。通过分离这些簇,你可以把细胞分成不同的细胞类型。但棘手的是决定一个集群在哪里停止,另一个集群在哪里开始……

用我的鼠标。我现在画了一些线,围绕着看起来像震中的点。我的台词写得怎么样了?

Páll -我认为到目前为止你做得很好。

伊娃-好的,很好。点击提交,看看效果如何。啊,过去了!嗯,上面说我现在是一名实习数据分析师,所以我对这个结果很满意……

所以这都是有趣的游戏,但这也是所谓的公民科学的一个很好的例子。Jérôme waldishhl,该项目的另一位负责人。

Jérôme -公民科学是让大众参与科学发现过程的过程。这就是我们在探索项目中所做的。

伊娃:这不仅仅是让更多的人参与科学。有这么多的人关注同样的数据意味着分析的结果更加可靠,也意味着数据可以用比科学家们自己做的更深入的方式进行探索。

Ryan:我们与许多提供数据的科学家进行了一对一的合作。老实说,他们对球员们必须得到的结果感到非常兴奋。

Eva:这对Ryan和Jérôme的团队来说也很好,因为在项目开始的最后几个月里,他们已经收到了超过4800万份流式细胞术分析,这是他们训练人工智能算法自动进行分析的良好基础。到目前为止,已有超过17万名玩家参与其中,这个数字只会越来越大。杰西。

Jesse -我鼓励每个人,即使你从未玩过EVE Online,并且你想为冠状病毒的研究做出贡献,也可以尝试一下。上面有一些很酷的图形来展示流式细胞术是如何工作的。这是非常简单,容易,有趣,和治疗参与。

Eva -对于Jérôme来说,这不仅仅是关于流式细胞术,不仅仅是训练算法……甚至比冠状病毒本身还要多。

Jérôme -因为最终,你想做的是向人们展示做科学并没有那么复杂。事实上,它可以很有趣。通过游戏来做这件事可以让你消除我们为科学做贡献时设置的心理障碍,当你开始做这件事时,你会意识到你可以有所作为,我们可以一起朝着这个以科学为基础的社会前进。

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