用电脑游戏解决科学问题

在这篇新闻快讯中,我们将听到电脑游戏玩家如何帮助解决科学难题,为什么你没有你想象的那么好,以及大脑如何控制免疫系统……
9月19日

在这篇新闻快讯中,我们将听到电脑游戏玩家如何帮助解决科学难题,为什么你没有你想象的那么好,以及大脑如何控制免疫系统。另外,新的CT扫描设备如何提供超快速3D x射线视觉!

在这一集里

DreamHack局域网派对。

00:30 -电脑玩家解决蛋白质难题

在线电脑游戏有时被视为一种纯粹的消遣,没有多少外在的好处,但新的研究表明,玩一款名为Foldit的在线游戏的玩家如何成功地破解了梅森-辉瑞猴病毒产生的一种重要蛋白质的三维结构,这种病毒会导致猴子患上类似艾滋病的疾病……

电脑游戏玩家解决蛋白质难题

在线电脑游戏有时被视为一种纯粹的消遣,没有太多的外在好处,但今天发表在该杂志上的一篇新论文自然、结构与分子生物学揭示了玩一款名为Foldit的在线游戏的玩家如何成功破解梅森-辉瑞猴病毒产生的一种重要蛋白质的三维结构,这种病毒会导致猴子患上类似艾滋病的疾病。

弄清楚蛋白质的确切三维结构对于理解它们是如何工作的非常重要,对于开发针对它们的有效药物也非常重要——经常听的人可能还记得这篇论文的主要作者大卫·贝克教授在8月份的节目中谈到过这一点。有几种实验室技术可以用来计算蛋白质结构,但这些技术并不总是提供一个明确的答案,而且往往依赖于一个好的模型来解释物理数据。在猴子病毒蛋白的案例中,科学家们花了很长时间想要找到一个解决方案,但没有成功。因此,研究人员求助于Foldit玩家的聪明才智,试图创造出3d结构。

要揭示蛋白质的3-D结构需要大量的计算能力——有一个叫做Rosetta的大型服务器,它也使用分布式计算能力——这是人们家用电脑不使用时的能力——以一种自动化的方式在数百万种可能的蛋白质结构中进行搅拌,以寻找那些看起来最可能的蛋白质结构。但是,在某些情况下,比如这个猴子病毒蛋白,罗塞塔仍然没有提供正确的答案,需要一点人类的直觉和解决难题的能力。

在这种情况下,研究人员给了Foldit游戏玩家一些关于蛋白质可能结构的基本信息,这些信息是基于一种叫做核磁共振光谱的技术的数据。玩家们开始工作,想出了一个模型,然后对其进行调整。研究人员特别指出,spvincent、grabhorn和mimi这三个参与者在解决结构问题上取得了具体突破。

一旦玩家基于合理的生化和物理原理提出了一个好的模型,研究人员就可以使用该模型作为解释蛋白质物理分析数据的基础,使用一种称为x射线晶体学的技术。他们发现这是一个非常好的匹配,证明Foldit游戏玩家准确地预测了蛋白质的结构。

在猴子病毒蛋白的例子中,最终的结构揭示了一些有趣的区域,这些区域可以被专门设计的药物靶向。但更重要的是,这是首次展示了网络游戏玩家通过将计算能力与人类大脑相结合来解决长期存在的科学问题的能力和创造力。这并不一定需要训练有素的科学家的大脑,因为大多数Foldit玩家都没有生物化学背景。考虑到还有更多未解的蛋白质结构,很可能Foldit游戏玩家在未来会取得更多的突破——很高兴知道他们坐在家里的电脑前为科学做出了巨大的贡献。

《大卫和歌利亚》,1888年,奥斯马尔·辛德勒(1869-1927)

04:07 -过度自信是人类的常态

科学家发现,人类在进化过程中对自己的能力产生了一种过度膨胀的感觉。这种对自己的乐观信念在生物学上是有益的,只要别人的能力不确定,胜利是值得的……

过度自信是人类的常态

人类已经进化到对自己的能力有一种过度膨胀的感觉,这大卫和歌利亚科学家们发现,它最终能帮助我们在逆境中生存下来。

从生物学角度来说,过度自信的倾向应该是有益的,这听起来有点违反直觉,但通过建立一个数学模型,让名义上的“玩家”争夺有限的资源,并根据对对手明显优势的评估来决定是战斗还是退缩,加州大学圣地亚哥分校的研究人员詹姆斯·福勒和爱丁堡大学的科学家多米尼克·约翰逊表明,最好的策略是在乐观的一面犯错。

换句话说,如果赌注足够大,从可能会赢的冲突中抽身而退的成本会被赌博带来的潜在收益所抵消。这种对人类自我信念的过度夸大或许可以解释我们的很多行为,比如金融泡沫、我们无法取胜的战争、吸烟或危险驾驶的倾向,甚至约翰逊指出的对气候变化的自满。

发表于期刊自然这项研究也在一定程度上解释了为什么94%的大学讲师在被问及自己的教学技能时,认为自己“高于平均水平”。事实上,唯一看起来对世界有准确看法的人是那些患有抑郁症的人,他们表现出所谓的“抑郁现实主义”。从他们的经验来看,活跃我们的个人属性的好处是显而易见的。

“正是这种对世界不切实际的看法让我们度过了一生,”约翰逊说。

三维重建骨

07:18 -新型超级CT扫描仪的X射线视觉

史前海洋怪物、人体组织、飞机机翼,甚至鳄鱼粪便化石,都在向一个独特的新x射线成像中心展示它们内心深处的秘密。

新型超级CT扫描仪的X射线视觉
伊恩·辛克莱教授,南安普顿大学

克里斯——南安普顿大学新近投入使用的价值数百万英镑的x射线成像设备为从气候变化到进化的一系列领域提供了新的见解。他们在现场安装的综合设备不仅意味着很多东西都可以被快速扫描,而且也非常大,我的意思是认真大的东西是可以研究的——他们研究的对象从恐龙遗骸到飞机碎片,甚至鳄鱼的粪便。简·莱克一直在调查这一切。

三维x射线视觉不再只是像超人这样的虚构人物的领域。对于南安普顿大学的伊恩·辛克莱教授和他的团队来说,这只是一天的工作。使用一种叫做计算机断层扫描(CT)的东西,他们可以发现自己在做任何事情,从凝视一个巨大的海洋生物化石的颌骨到观察一个垃圾填埋场不那么吸引人的错综复杂的地方。

这个术语断层扫描的意思是通过切片来观察物体,但是当我们进行计算机断层扫描的时候,它的好处是你不需要把物体切开来观察这些切片。事实上,如果你能一次把一些东西切成很多片,你就能得到里面的3D图像。该中心提供了英国大学中最大的高能、高分辨率计算机断层扫描能力。这项工作的进一步重要推力不仅仅是规模。它是我们可以输入的样本数。除了这台非常大的扫描机,我们还有另一台设备放在它旁边,可以处理较小的物体。在那台机器中,我们基本上可以以比英国或世界各地的类似系统快十倍的速度进行扫描。不仅仅是扫描仪的问题。我们将计算硬件和分析软件集成到一个完整的工作流程中,在这个流程中,端到端的整体生产力将比其他地方更快。三维重建骨

简-该中心是由工程和物理科学研究委员会支持的。它被用于一系列令人难以置信的项目,包括斯塔福德郡宝藏的研究,这是有史以来发现的最大的盎格鲁-撒克逊黄金,植物根系的结构以及它们如何应对未来的气候变化,以及人类健康和疾病的发展。然而,即使是这个列表也不能涵盖所有内容……

伊恩:我们有垃圾,真正的垃圾从垃圾填埋场被拉上来。了解垃圾填埋场的行为是一个非常重要的工程挑战。我们在各种应用结构的复合材料性能方面做着创新的、绝对世界领先的工作。我们使用CT的水平可以看到飞机的机翼,如果我们真的,真的需要;找到单个碳纤维。我们可以理解复合结构,加载它们,导致它们失效,理解这些失效,并产生新的模型,这些模型将可靠地允许工程师用这些材料进行设计,以一种他们目前无法做到的方式。

Jane -在最大的扫描仪4吨的门后面,最令人兴奋的项目之一是在英格兰侏罗纪海岸发现的一个巨大的上龙头骨化石。

上龙是一种可怕的野兽,大约有17米长。这些碎片是大块的岩石,把头骨分解成的小块,扫描它们,得到确切的结构,然后用数字技术重建它,这是非常有趣的。我们还可以看到相当逼真的内部结构,我们可以分辨出血管,神经通道的位置,肌腱的位置它们将整个组织连接在一起。世界上只发现了少数几个头骨,我们的头骨是最完整、最不变形的头骨之一。因此,它是获取信息的非常有价值的资源。

在非洲的一次考古发掘中,一个不寻常的发现为人类的进化提供了新的见解。

伊恩:所以这是一个非常有趣的故事,一块不起眼的棕色岩石被带到实验室,人们认为它可能是鳄鱼粪便化石,也可能不是。这是在非洲的一个地区发现的,那里居住着类人猿,即人类的祖先。人们认为了解他们生活的条件和环境非常重要,特别是,那里有水吗,周围有湖泊吗,周围有沼泽吗。潜在的问题是,生活在水里和水周围是猿类变成两条腿并随后进化成我们现在这样的人类的驱动力之一吗?我们给它拍了照片,他们得出的结论是这是鳄鱼的粪便。这个奇怪的、不起眼的小块自然变成了人类发展和进化更大图景的一部分。

简:从长远来看,谁知道这个中心还能有什么其他用途?有点像超人的力量,它似乎是无限的可能性。

伊恩:机会太多了。有时它似乎是无限的。我用这个术语来形容人们想象自己拥有超人的即时3D x光视力。在某种程度上,这就是它给你的——类似的东西可以实现。

单个人淋巴细胞的电子显微镜图像。

13:07 -身体的防御系统不受大脑控制

一种使大脑能够控制免疫系统的神经化学回路首次被发现。

身体的防御系统不受大脑的控制

一种神经化学回路使大脑能够控制免疫系统人类淋巴细胞这是第一次被揭露。

多年来,科学家们已经知道心理和免疫系统功能之间的强大联系,尽管这种关系的神经基础仍然笼罩在神秘之中。

现在,纽约范斯坦医学研究所和斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所的一个研究小组在杂志上写道科学,已经揭开了连接神经系统和免疫系统的通讯系统的工作原理。真正令人惊讶的是,免疫细胞本身充当中间人,将神经细胞的化学信息传递给其他免疫信号细胞。

本研究的资深作者凯文·特蕾西(Kevin Tracey)之前的研究表明,刺激迷走神经(迷走神经从脑干向身体许多部位的组织输送神经)可以阻止免疫系统发出炎症信号。负责的信号似乎是一种众所周知的神经递质化学物质乙酰胆碱。但这个故事的亮点是迷走神经似乎并没有产生它!

现在,通过研究实验小鼠的脾脏,研究小组解开了这个谜团。被称为CD4淋巴细胞的脾脏白细胞,当被炎症过程激活时,对神经递质化学物质去甲肾上腺素变得敏感,去甲肾上腺素是由迷走神经脾支在脾脏中分泌的。然后,CD4淋巴细胞自身分泌乙酰胆碱,从而阻止附近其他细胞产生炎症化学物质。

该团队通过在缺乏自身CD4细胞的小鼠身上进行实验来证明这一点;当它们的迷走神经受到刺激时,这些动物并没有关闭炎症介质的供应。但是,当活化的CD4细胞从供体小鼠输注到动物体内时,它们立即开始大量分泌乙酰胆碱,从而抑制了炎症过程。关闭在这些细胞中产生乙酰胆碱的ChAT基因,也阻止了任何反应。

重要的是,正如研究小组在他们的论文中指出的那样,他们发现的调节系统并不局限于脾脏,因为相同种类的CD4淋巴细胞存在于全身,特别是在淋巴腺和肠道中被称为Peyer's Patches的特殊淋巴组织中。这意味着该系统几乎肯定在控制全身炎症方面起着重要作用,操纵它可能是控制自身免疫和其他相关疾病的关键……

父亲和孩子

15:29 -接种疫苗,识破谎言和有父爱的男人

本周的科学新闻综述,包括疫苗植入、测谎、危险因素和父亲的睾丸激素水平……

种植疫苗,识破谎言和父亲般的男人
麦吉尔大学布赖恩·沃德;弗朗西丝·沃尔,埃克塞特大学;布拉德福德大学的Prashant Pillai;哈桑·尤盖尔,布拉德福德大学;Christopher Kuzawa,西北大学。

种植疫苗

弗吉尼亚州查塔姆的一片烟草种植园烟草植物可能是未来大规模生产流感疫苗的关键。

本周在马耳他举行的ESWI流感会议上公布了一项研究,加拿大生物技术公司Medicago将编码流感病毒外壳的基因添加到烟草植物中。它们产生类似流感病毒的免疫刺激颗粒,但不含任何感染性成分。布莱恩·沃德教授是Medicago的医疗官…

病毒蛋白然后迁移到植物细胞的表面,自动组装成这种小的病毒状颗粒,从外面看,像病毒,但内部什么也没有。

---

元素风险表

移动电话英国地质调查局发布了一份“危险清单”,列出了52种可能很快就会短缺的化学元素。

在编制这份清单时,考虑了这些元素开采国的丰度、储量位置和政治稳定性,排名靠前的是铂、钨和稀土等金属。埃克塞特大学矿物学教授弗朗西斯·沃尔……

弗朗西丝:所以像混合动力汽车、风力涡轮机、手机这样的东西,都使用了大量的元素。在移动电话中,大约有66种不同的化学元素被整合到这项技术中。所以我们现在需要看看元素周期表中所有元素的可用性。

----

眼动控制轮椅眼控轮椅

米拉-轮椅使用者很快就可以用他们的眼睛来指示他们要去的地方。布拉德福德大学(University of Bradford)的普拉桑特·皮莱(Prashant Pillai)团队开发了一种类似眼镜的跟踪设备,该设备与电动轮椅结合使用,利用摄像头跟踪佩戴者眼睛的位置。

Prashant -最重要的事情是给残疾人更多的独立性。我们的最终目标是建造一个你可以通过查看不同的电器来控制的房子。你可以看看电视,打开它,看看收音机,打开它,然后坐上轮椅,然后看看你想去的地方,它就会带你去。

---

情绪侦测扫描器

Meera——英国科学家发明的一种照相机可以探测到一个人在说假话。

该设备可以检测面部变化,包括表情变化、血液流动和眼球运动,这些都与说谎有关。发明者哈西安·尤盖尔就职于布拉德福德大学。

Hassan -我们的准确率是70%,这意味着我们可以发现3个谎言中的2个。我们希望能超越这一水平,达到90%。我们在警察审讯场景,移民,边境控制点,任何涉及面试的地方都能看到这一点,包括潜在的工作面试。

---

父亲的睾丸激素父亲和孩子

米拉-最后,当男人成为父亲时,他们体内的睾丸激素水平会下降。

西北大学的克里斯托弗·库泽(Christopher Kuzawa)领导的一项针对菲律宾600多名年轻男性的试验发现,单身男性的睾丸激素水平高于那些已经成为父亲的男性,而那些帮忙照顾孩子的男性的睾丸激素水平则下降了34%……

克里斯托弗-与孩子互动似乎会降低男性的睾丸激素,但我们也从之前的研究中知道,男性在怀孕期间,即将出生,你会看到他们的睾丸激素在孩子出生前下降。所以,这表明可能有心理上的原因,也可能是即将出生的压力。我们不太清楚,但似乎有多种方式可以让孩子降低男性的睾丸激素。

这项研究表明,这是一种进化适应,利用高水平的睾丸激素来吸引和确保配偶,而当父亲时睾丸激素水平较低,从生物学上讲,男性会帮助抚养孩子。

---

评论

添加注释