SARS-CoV-2的进化溢出?

我们找到了一个近亲，但还不足以告诉我们SARS-CoV-2病毒的确切来源。杰西·布鲁姆解释了这是如何导致病毒如何获得看似新颖的基因变化的两种理论…

杰西-有两种可能的解释。一种可能的理论是，它以某种方式通过自然感染到达那里——它自然地感染了一些旅行到那里的人或一些被转移到那里的动物。另一种可能性是，众所周知，武汉有许多实验室收集了大量与蝙蝠SARS相关的冠状病毒，并将它们带回武汉进行研究。所以，也有可能是科学家收集了类似的病毒，把它带回武汉，然后发生了某种事故。

Julia -几乎所有重大的人类传染病暴发都是由于病毒、细菌或寄生虫从动物身上传染给人类而发生的。

克里斯-中世纪的黑死病是有史以来最致命的流行病，是由一种细菌引起的，这种细菌从野生草原土拨鼠传染给黑鼠，然后传染给它们的跳蚤，最后传染给我们人类。流感大流行始于禽类。

朱莉娅:就像我们听到的非典和中东呼吸综合征一样，这两种病毒都起源于马蹄蝠，并通过两种不同的中间物种，棕榈果子狸和骆驼，它们能够在人类宿主体内找到自己。

克里斯-这种进化溢出一直是我们在SARS-CoV-2基因组中观察到的差异背后的主要理论。

Julia - Aris Katzourakis解释道。

Aris -在寻找这些被称为sarbecovirus的病毒的来源的过程中，科学家们读取了SARS CoV2分离株的基因组，并将其与其他与SARS CoV2基因相关的病毒进行了比较，并试图利用它来解开这些传播模式。通过将序列与蝙蝠、穿山甲或其他携带sarbecovirus的哺乳动物的类似序列进行比较，我们可以制作一棵进化树，并尝试找出SARS CoV2在这种病毒多样性中的位置。它通常嵌套在病毒谱系中，包括许多蝙蝠病毒。因此，虽然我们不一定能找到导致SARS CoV2和COVID传播的确切蝙蝠，但这似乎是一个更大的病毒家族的一部分，其中包括在蝙蝠中发现的许多病毒。

朱莉娅-研究人员一直在不知疲倦地寻找野外SARS CoV2的近亲，因为这可能使我们更接近这种病毒的传播地点。

阿里斯:我认为，公平地说，人们已经尽可能地对这种病毒进行了严格的采样，但受到限制，而且现实情况是，你不可能挑选出每一种哺乳动物。有一件事是有时会发生的，直接祖先的真正明显的例子是，当你的采样序列在你的系统发育树中形成一个锥形结构，你感兴趣的一个序列从这个锥形的顶端伸出来。对于SARS CoV2，我们并没有这样的病毒，但我们肯定有很多类似蝙蝠的病毒围绕着这些感兴趣的序列。

朱莉娅:虽然我们还没有找到中间媒介或更近的亲戚，但我们希望看到病毒是否已经从动物跳到人类身上，这并不意味着它不存在。

阿里斯-如果你想想艾滋病毒和寻找艾滋病毒的祖先，比如说，找到黑猩猩的确切谱系花了很长时间，而黑猩猩与艾滋病毒的传播关系最为密切。找到直接的祖先，真正的黑猩猩在灌木丛后面，给了最初的传播事件，这不是我们仍然拥有的东西。我们没有一个完美的序列，尽管现在很明显，黑猩猩已经传播了HIV-1。在SARS 1的研究中，我们也看到了一系列虚假的曙光，以寻找该疫情的始祖。花了一段时间才确定了最有可能的来源物种。这只是一个范围之广的问题。蝙蝠有一千多种，有那么多不同的种群需要采样，要找到一个直系祖先可能是不可能的。

朱莉娅:所以，我们还没有发现它并不意味着它不存在?

阿里斯-没错。

朱莉娅-研究人员仍然相信这种病毒来自大自然的其他一些原因来自于有信息显示，武汉的菜市场上曾出现过可以携带冠状病毒的稀有动物，这可能使科学家很难找到他们所寻找的中间媒介。

克里斯-此外，对病毒的早期追踪表明，它可能同时出现在多个菜市场，这可能表明一批动物或不同的交易商是感染源。

朱莉娅-工作正在继续努力寻找SARS CoV-2的近亲的自然储存库。