阿尔达布拉巨龟基因组测序

上周的诺贝尔奖引发了所有关于基因组测序的讨论，似乎动物王国的另一个成员已经完成了遗传密码测序:这次轮到阿尔达布拉巨龟了，这些基因数据可能很快就会出来。顾名思义，这些温和的巨人会长得很大:有些可以达到300公斤——和灰熊一样重——它们可以活250年。令人遗憾的是，自19世纪它们与人类接触以来，它们的数量急剧下降。值得庆幸的是，由于保护措施的努力，它们的数量再次上升，但从如此少的个体恢复种群意味着缺乏遗传多样性，使它们容易受到疾病和环境威胁的影响。因此，了解它们的基因组是至关重要的，以便知道谁应该与谁交配，以尽量减少进一步近亲繁殖的风险。威尔·廷格尔接受了苏黎世大学Gözde Çilingir的采访。

Gözde -世界各地都有许多阿尔达布拉巨型龟。我们实际上不知道阿尔达布拉之外还有多少遗传变异。为了理解这种变化，我们需要参考。仅存的野生种群是来自野外的主要信息。但是了解它们的自然种群之外还剩下什么是非常重要的。首先要了解脆弱物种的整体多样性。第二，动物园。有一些繁殖努力正在进行，以增加阿尔达布拉巨龟的数量，为了更好地管理这些繁殖努力，我们需要了解哪些个体来自阿尔达布拉的哪个部分，例如，参考基因组和种群遗传学分析有助于我们理解和管理这些繁殖努力。

威尔:这项更大范围的研究不仅仅是这样，因为阿尔达布拉巨龟作为生态系统工程师，恢复退化的岛屿栖息地。因此，了解如何更好地保护这些陆龟，应该也会对它们生态系统的其他部分产生连锁反应。

Gözde -没错，因为它们是生态系统中最大的食草动物，它们基本上是对植被动态有直接影响的关键物种之一。以前，西印度洋群岛上生活着许多巨型陆龟，但野生的只有阿尔达布拉巨型陆龟。因此，阿尔达布拉巨龟被有效地用于岛屿的重新野生化，这些岛屿曾经有自己的巨龟，基本上它们是替代品。生态系统从巨龟身上滚下来，帮助恢复了创造的栖息地。所以所有的重新放归野外的努力对这个物种来说意味着另一个瓶颈，因为基本上只有几个个体被选择引入野外。因此，如果我们能够更好地管理这些重新野生的种群，最大化这些个体的遗传变异，那么我们就可以减少遗传漂变的潜在有害影响。这可能有助于我们确保它们被引入的地方的重新野生种群的长期生存。

最后一点，这种测序是否可以扩展到其他乌龟物种?

Gözde -是的，它可以。我的意思是，我认为这是一件让我非常惊讶的事情，因为在一天结束的时候，我们制作了一个基因组工具，它不仅对阿尔达布拉巨龟有帮助，而且对马达加斯加或东非或其他地方特有的其他陆龟物种也有帮助。这背后有几个原因。首先，在我们的工作中，在我们的论文中，我们展示了大多数阿尔达布拉巨龟的基因组与其他海龟物种相似。我们也知道乌龟的进化速度比其他脊椎动物要低。因此，阿尔达布拉巨龟的基因组可以有效地用于这些物种的其他基因组保护项目，这对我这个保护遗传学家来说真的很令人兴奋，因为这个工具也可以帮助马达加斯加极度濒危的陆龟，例如，以及它们的基因保护。